RNA结合蛋白S1; RNPS1
HGNC 批准基因符号:RNPS1
细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:2,253,116-2,268,126(来自 NCBI)
▼ 说明
mRNA 的剪接必须高度精确,才能将正确的遗传信息携带到细胞质中作为转录的模板。另一方面,它也很灵活,允许选择性剪接,这可以允许基因表达的组织特异性和生理学和发育控制的调节。剪接过程涉及剪接复合物或剪接体中的 50 多种蛋白质。RNPS1 调节多种前体 mRNA 的选择性剪接。
▼ 克隆与表达
Badolato等人(1995)通过用包含骨钙素(112260)维生素D反应元件的探针筛选骨肉瘤cDNA文库,然后探测海马cDNA文库,孤立出编码RNPS1的cDNA,他们将其命名为E5.1。序列分析预测 305 个氨基酸的 RNPS1 蛋白具有与老鼠蛋白 100% 相同的长序列。RNPS1具有长的N端富含丝氨酸(SR)区域;包含 RNP1 和 RNP2 子基序的 90 个残基 RNA 识别基序;SR剪接蛋白基序;2 个富含 arg 的 RNA 结合结构域;和C端核定位信号。Northern 印迹分析揭示了 2.4 kb RNPS1 转录物的普遍表达。在细胞周期进展期间或用孕激素治疗后,表达没有显着变化。
▼ 生化特征
Loyer et al.(1998)通过酵母2-杂交、免疫共沉淀和Western blot分析表明PITSLRE的p110亚型的N末端(参见CDC2L1;176873),而不是其他亚型,与 RNPS1 的 N 端 RNA 结合域相互作用。免疫荧光分析证明了两种蛋白在大核斑点中的表达。
▼ 基因功能
Mayeda et al.(1999)表明RNPS1的表达与SR蛋白协同作用,强烈激活组成型和选择性剪接前mRNA的剪接。
Lykke-Andersen et al.(2001)通过Northern blot分析确定了RNPS1或UPF3B(300298)的表达,以及较小程度的Y14(RBM8A;605313),存在野生型或显性失活UPF1(RENT1; 601430)当连接到β-珠蛋白mRNA的3-prime非翻译区时标记无义介导的衰变(NMD)的mRNA。DEK(125264)、ALY(604171)或SRM160(605975)没有出现这种情况。荧光显微镜证明 RNPS1 是一种核质穿梭蛋白。免疫共沉淀分析表明,RNPS1 与 UPF3A(605530)、UPF3B(各 2 个剪接变体)、UPF2(605529)和 UPF1 存在高水平关联。Y14和TAP(NXF1; 602647)也在复合物中被发现并且全部组装在外显子-外显子连接处。Lykke-Andersen等人(2001)得出结论,剪接后蛋白Y14、RNPS1和UPF3B在与mRNA输出受体NXF1结合后保留在mRNA上,而ALY和SRM160解离。如果终止发生在最后一个外显子-外显子连接的上游,则会触发 mRNA 脱帽,然后进行快速 NMD。
通过对全长 RNPS1 和几个缺失突变体进行酵母 2 杂交分析,Sakashita 等人(2004)鉴定了几个与 HeLa 细胞中 RNPS1 的各个结构域相互作用的剪接相关因子。SFRS11(600326)、pinin(603154)和TRA2B(602719)与N端富含丝氨酸结构域、中心RNA识别基序(RRM)和C端富含精氨酸/丝氨酸/脯氨酸(RSP)相互作用分别是 RNPS1 的结构域。RNPS1 与这些因子之间的蛋白质-蛋白质结合已在体外和体内得到验证。HeLa 细胞中 RNPS1 的过度表达会诱导模型 β-珠蛋白前体 mRNA 和人 TRA2B 前体 mRNA 中的外显子跳跃。RNPS1 和 SFRS11 的共表达协同刺激 ATP 合酶 γ 子单元(108729)前 mRNA 中的外显子包含。RSP结构域和RRM对于外显子跳跃活性是必需的,而富含丝氨酸的结构域对于与SFRS11的协同作用很重要。Sakashita et al.(2004)得出结论,RNPS1是调节多种前体mRNA选择性剪接的多功能因子。
▼ 测绘
Burn等人(1996)通过捕获P1重叠群的外显子,将RNPS1基因定位到16p13.3。