胶原蛋白,XXV 型,α-1; COL25A1
类胶原蛋白阿尔茨海默病淀粉样斑块成分前体
CLAC 前体; CLACP
此条目中代表的其他实体:
包含类胶原蛋白阿尔茨海默淀粉样斑块成分;CLAC,包括
HGNC 批准的基因符号:COL25A1
细胞遗传学定位:4q25 基因组坐标(GRCh38):4:108,808,725-109,302,658(来自 NCBI)
▼ 说明
COL25A1 是一种脑特异性膜结合胶原蛋白。蛋白水解过程释放 CLAC,这是一种可溶形式的 COL25A1,含有与阿尔茨海默病(AD;AD;老年斑)相关的细胞外胶原结构域。104300)大脑(Osada et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
Hashimoto et al.(2002)通过对从AD大脑老年斑中纯化的CLAC蛋白进行测序,然后进行数据库分析,筛选人脑cDNA文库,并进行RACE,克隆了COL25A1,他们将其称为CLACP。推导的 654 个氨基酸蛋白包含一个 N 端非胶原结构域、一个跨膜区域和 3 个 gly-XY 胶原蛋白样重复结构域,两侧有 4 个非胶原结构域。N末端在细胞内,胶原结构域在细胞外,arg112和glu113之间有一个共同的弗林蛋白酶(136950)位点用于蛋白水解切割。Hashimoto et al.(2002)还鉴定了 4 个选择性剪接变体,它们赋予细胞外胶原蛋白样重复序列的可变性。对小鼠组织的 Northern 印迹分析仅在大脑中检测到 4.4 kb Col25a1 转录物,但 RT-PCR 显示在心脏、睾丸和眼睛中也有微弱表达。老鼠大脑的原位杂交显示大脑新皮质、海马和其他皮质下核团的神经元中存在 Col25a1。转染的人胚胎肾细胞的 SDS-PAGE 在还原条件下检测到 80 kD 的 COL25A1 单体,在非还原条件下检测到 160 和 240 kD 的多聚体,表明 COL25A1 呈现三螺旋构型。
Hashimoto et al.(2002)发现从AD老年斑中分离的CLAC蛋白是COL25A1的加工形式,缺乏跨膜和细胞内成分。他们鉴定出 70-kD CLAC 蛋白是 COL25A1 的弗林蛋白酶裂解产物,其 N 末端有焦谷氨酸 113。免疫组织化学分析显示CLAC主要存在于原始型或神经炎型淀粉样蛋白-β(A-β;104760)-阳性斑块,与厚束状或粗颗粒状结构相关。AD 大脑、非痴呆大脑和所有正常大脑结构中其他类型淀粉样蛋白沉积物的 CLAC 染色呈阴性。
Soderberg 等人(2005)从脑 cDNA 文库中克隆了编码 580 个氨基酸蛋白质的 COL25A1 剪接变体。该 COL25A1 变体的蛋白水解加工从转染的人胚胎肾细胞中释放出表观分子量为 75 kD 的可溶性单体 CLAC 蛋白。分泌的蛋白质以 glu113 开始,含有 11% 羟基化脯氨酸和 49% 羟基化赖氨酸。CLAC 显示出胶原蛋白的特征:它形成部分蛋白酶抗性的三螺旋结构,对肝素表现出中等亲和力,并含有几个糖苷酶无法接近的碳水化合物基团。
Shinwari等人(2015)发现COL25A1基因在成人和胎儿组织中普遍表达。在大脑中,海马和枕叶表达丰富,额叶和视颅神经表达中等,左侧小脑表达较低。COL25A1 在结膜成纤维细胞以及人类胎儿和成人的全眼和眼肌中表达。
▼ 测绘
Hashimoto等(2002)通过基因组序列分析,将COL25A1基因定位到染色体4q。
▼ 基因功能
Hashimoto et al.(2002)发现,可溶性 CLAC 和膜结合的 COL25A1 都通过被高盐破坏的离子相互作用结合原纤维化但不溶解的 A-β 形式。
Soderberg et al.(2005)使用固相结合测定法发现,源自 580 个氨基酸的 COL25A1 亚型的分泌 CLAC 蛋白以相似的亲和力与 A-β(1-40)的聚集体结合,但不是可溶形式。 )和A-β(1-42)。CLAC还与NAC结合,NAC是α-突触核蛋白的35个残基片段(SNCA;163890),但对胰淀素的亲和力要低得多(IAPP; 147940)。CLAC 前 2 个胶原结构域之间的非胶原结构域中的 8 个残基序列对于与 A-β 的相互作用至关重要。CLAC 还通过第一个胶原结构域中的 2 个肝素结合共有序列在体外结合固定化肝素。
Osada et al.(2005)发现CLAC与纤维化A-β之间的相互作用需要CLAC的三螺旋结构,并以剂量依赖性方式被肝素抑制。突变分析表明,CLAC 第一个胶原结构域中带正电荷的氨基酸簇介导其与 A-β 的相互作用。Osada等人(2005)证明可溶性CLAC抑制A-β在其伸长阶段的原纤维化,但对A-β成核或原纤维种子的形成没有影响。
▼ 分子遗传学
3名同胞,父母为沙特阿拉伯近亲所生,患有先天性眼外肌纤维化-5(CFEOM5; Shinwari et al.(2015)在COL25A1基因(G382R; 616219)中发现了影响Gly-Pro_X片段的纯合错义突变。610004.0001)。该突变是通过连锁分析和候选基因测序发现的,并通过全外显子组和桑格测序证实,与家族中的疾病分离。对另外 41 名 CFEOM 患者的 COL25A1 基因进行分析,发现 1 名患者存在复合杂合无效突变(610004.0002 和 610004.0003)。Shinwari等人(2015)假设COL25A1的缺乏可能会对参与轴突引导的信号级联产生不利影响,导致细胞骨架微管动力学异常和非典型眼部运动神经元发育。
▼ 动物模型
Tong等人(2010)培育了过度表达人类COL25A1的转基因小鼠,并观察到大脑中β-淀粉样蛋白的积累与Bace1(604252)水平增加和Cdk5r1(603460)水平增加相关,从而激活Cdk5(123831)。这些变化与突触素(SYP;SYP;313475)、星形胶质细胞激活和行为异常。研究结果表明COL25A1可能在阿尔茨海默病的发病机制中发挥作用。
▼ 等位基因变异体(3个精选例子):
.0001 眼外肌纤维化,先天性,5
COL25A1、GLY382ARG
沙特阿拉伯近亲家庭的 3 名患者患有先天性眼外肌纤维化-5(CFEOM5;616219),Shinwari 等人(2015)在 COL25A1 基因的外显子 21 中发现了纯合的 c.1144G-A 转变,导致重复的 Gly-Pro_X 片段内出现 gly382 到 arg(G382R)的取代。通过连锁分析和候选基因测序发现的突变与家族中的疾病分离,并且在 500 个种族匹配的对照中未发现。此外,该突变经全外显子组测序和桑格测序证实,在dbSNP(build 137)和千人基因组计划数据库中不存在。HEK293 细胞的体外功能表达研究表明,该突变导致稳定性丧失和不正确的折叠,这可能使可溶性成分易于蛋白水解。
.0002 眼外肌纤维化,先天性,5
COL25A1、GLY497TER
先天性眼外肌纤维化-5(CFEOM5;616219)表现为杜安回缩综合征,Shinwari et al.(2015)鉴定了COL25A1基因外显子28中c.1489G-T颠换的复合杂合性,导致gly497-to-ter(G497X)取代,以及12.4 -kb 缺失(610004.0003),跨越 COL25A1 基因的外显子 4 至 10(chr4:109,852,901-109,976,457, GRCh37)。通过CFEOM对41名先证者的COL25A1基因外显子进行测序,发现突变和缺失。患者父母的 DNA 无法用于分析。此外,c.1489G-T突变经全外显子组测序和Sanger测序证实,在dbSNP(build 137)和千人基因组计划数据库中不存在。G497X 截短会导致 COL3 和 NC4 结构域丢失,而 12.4 kb 删除会导致整个 NC2 结构域以及部分 COL1 和 COL2 结构域丢失。患者样本显示 COL25A1 的可溶性胶原蛋白样淀粉样蛋白生成成分(sCLAC)水平下降,与功能丧失一致。与患者未受影响的同胞相比,患者血浆中可溶性 APP(104760)和 TUBB3(602661)水平也有所降低。Shinwari等人(2015)假设COL25A1的截短可能会对参与轴突引导的信号级联产生不利影响,导致细胞骨架微管动力学异常和非典型眼运动神经元发育。
.0003 眼外肌纤维化,先天性,5
COL25A1,12.4KB 删除
讨论先天性眼外肌纤维化-5(CFEOM5;CFEOM5;Shinwari 等人(2015 年),参见 616219),参见 610004.0002。