小核仁 RNA,C/D 框,112; SNORD112
snoRNA 14q(0)
HGNC 批准的基因符号:SNORD112
细胞遗传学定位:14q32.2 基因组坐标(GRCh38):14:100,897,920-100,897,996(来自 NCBI)
▼ 说明
小核仁RNA(snoRNAs),如SNORD112,通过每个修饰位点的特定RNA双链体引导核糖体RNA(rRNA)和U小核RNA(snRNAs)2-引物O-甲基化的形成(Cavaille et al., 2002) )。
▼ 克隆与表达
通过在人类染色体 14 的同线性区域中寻找来自大鼠染色体 6 的印记 snoRNA 基因的人类直系同源物,Cavaille 等人(2002)在 MEG8 基因的内含子内鉴定了 SNORD112,他们将其称为 14q(0)(613648) )。在MEG8的下游,他们鉴定了9个串联拷贝的SNORD113(见613650),随后是31个串联拷贝的SNORD114(见613651),他们分别将其称为14q(I)和14q(II)簇。每个 70 至 75 个核苷酸的 snoRNA 均包含特征性 C/D-prime/C-prime/D 基序和具有保守序列的末端 5-prime-to-3-prime 茎结构。几个重叠克隆的 RT-PCR 表明,大多数 snoRNA 基因源自大 RNA 的内含子,除了与 SNORD113 和 SNORD114 基因簇重叠的外显子之外,还包括上游 MEG8 基因的外显子。这个大的转录本似乎缺乏重要的蛋白质编码潜力。Northern印迹分析显示,SNORD112在大脑和子宫中表达最高,在心脏中表达较低,在其他检查组织中表达较弱。该表达模式与 SNORD113 和 SNORD114 相同。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Cavaille et al.(2002)将SNORD112基因定位到染色体14q32,位于MEG8基因的内含子内。