转录因子 CP2;TFCP2
α-珠蛋白转录因子 CP2
晚期 SV40 因子;LSF
此条目中代表的其他实体:
LBP1C,包含
LBP1D,包含
HGNC 批准的基因符号:TFCP2
细胞遗传学定位:12q13.12-q13.13 基因组坐标(GRCh38):12:51,093,656-51,173,135(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Swendeman et al.(1994)描述了 CP2 的基因组结构、染色体位置、启动子和表达模式,CP2 是一种 66-kD 的细胞转录因子,与 α-珠蛋白(141800)启动子以及其他细胞和病毒启动子相互作用元素。CP2 的同二聚体与 45 kD 的伴侣蛋白一起形成所谓的阶段选择器蛋白复合物(Jane et al., 1995),该复合物与近端 γ-球蛋白基因启动子调控序列结合,称为阶段选择器元件(SSE) )。SSE被认为参与胎儿红细胞生成过程中β珠蛋白基因(141900)转录的沉默(Cunningham et al., 1995)。
LBP1 是一种细胞蛋白,与人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)起始位点周围的序列强结合,与 TATA 框上的序列弱结合。Yoon等人(1994)使用从HeLa细胞提取物中纯化的LBP1设计的引物通过PCR获得了4个LBP1 cDNA,他们将其命名为LBP1A、LBP1B、LBP1C和LBP1D。LBP1A和LBP1B是UBP1(609784)的剪接变体,LBP1C和LBP1D是TFCP2的剪接变体。推导的 LBP1C 和 LBP1D 蛋白分别含有 502 和 451 个氨基酸。体外透视产生的蛋白质表观分子量分别为 64 和 58 kD。LBP1D 缺乏 LBP1C 中假定的 N 端 DNA 结合域的一部分。LBP1C 与 LBP1A 具有 72% 的氨基酸同一性,其中 N 端半部的同一性最高。
▼ 基因功能
Yoon等人(1994)发现LBP1C以序列特异性方式结合到HIV-1启动子上,但LBP1D没有。LBP1C 可以激活含有 LBP1 结合位点的启动子的转录。LBP1C和LBP1D都可以结合UBP1亚型LBP1A和LBP1B并形成异聚复合物。然而,LBP1D 抑制其他 LBP 与 DNA 上的 LBP1 识别位点的结合。
Yoo et al.(2009)通过cDNA微阵列、Western blot分析和荧光素酶报告基因检测发现肝细胞癌细胞(HCC;HCC)细胞核中LSF和LSF转录活性显着上调。114550)表达AEG1(MTDH:610323)与不表达AEG1的比较。LSF活性的增加与下游靶标胸苷酸合成酶(TYMS;)的显着增加相关。188350)在生长周期和二氢嘧啶脱氢酶(DPYD; 612779)。与未表达AEG1的细胞相比,转染AEG1的HCC细胞对5-氟尿嘧啶(5-FU)治疗表现出更强的抵抗力,这可以通过TYMS和DPYD的上调来解释。针对 AEG1、LSF 或 DPYD 的 siRNA 研究消除了 5-FU 耐药性。在用表达 AEG1 并表现出 5-FU 抗性的 HCC 细胞系转染的裸异种移植小鼠中,抑制 AEG1 会导致肿瘤生长显着受到抑制,并且 5-FU 和 AEG1 抑制的组合会对肿瘤生长产生相加效应抑制。研究结果表明,AEG1 通过诱导 LSF 和 DPYD 的表达而赋予对 5-FU 的耐药性,并指出 AEG1 在 HCC 发生和进展中的核心作用。
Yoo等(2010)利用免疫组织化学分析发现,与正常肝脏相比,人肝癌样本中LSF的核表达上调。FISH 表明,多个 HCC 样本中 LSF 表达升高是由于染色体 12 多体性所致。HepG3细胞中LSF的过度表达增加了细胞增殖、集落形成能力和软琼脂培养物中的贴壁孤立生长,并且增加了小鼠体内肿瘤血管生成和转移。显性失活 LSF 突变体的过度表达消除了这些效应。基因表达谱显示骨桥蛋白(OPN,或SPP1)的显着诱导;166490),一个在肿瘤转移中重要的基因。染色质免疫沉淀分析和报告基因测定证实 LSF 结合并激活 OPN 启动子。Yoo et al.(2010)的结论是,通过调节OPN的表达,LSF作为HCC发生和进展的关键调节因子发挥作用。
▼ 基因结构
Swendeman等人(1994)发现鼠和人的TFCP2基因分别含有16和15个外显子。两个基因都跨越约 30 kb 的染色体 DNA,并且在编码外显子中,所有外显子/内含子边界都是保守的。
▼ 测绘
Swendeman等(1994)通过对体细胞杂种的分析表明,人类TFCP2基因位于染色体12上,而种间回交分析表明,小鼠基因定位在染色体15的远端,与人类染色体12同线性。小鼠和人类启动子在跨过 450 个核苷酸的保守区域的多个起始位点启动 mRNA。
Cunningham等人(1995)通过荧光原位杂交将TFCP2基因定位到12q13,并位于NFE2(601490)的250 kb范围内,NFE2是另一种红细胞特异性转录因子,与β-珠蛋白基因座控制区(152424)中的序列结合。
▼ 分子遗传学
Lambert et al.(2000)报道了TFCP2 3-prime非翻译区的非编码多态性(GA)与散发性阿尔茨海默病(AD5;AD5)之间的关联。602096)在法国和英国人口中以及在北美人口中的类似趋势。3个孤立人群的综合分析表明A等位基因具有保护作用(OR = 0.58, 95% CI 0.44-0.75)。A 等位基因表现出与神经母细胞瘤细胞系核蛋白的结合减少,并且与对照相比,A 等位基因的缺失与 AD 病例淋巴细胞中较低的基因表达有关。作者认为,TFCP2 的多态性变异可能对 AD 的发病机制很重要,特别是因为该基因产物与 GSK3B(605004)、Fe65(602709)等蛋白质以及参与炎症反应的某些因子相互作用。
Taylor 等人(2001)报道了对 216 例尸检确诊的阿尔茨海默病病例和 301 例年龄超过 73 岁的非痴呆对照病例的分析。与对照组相比,阿尔茨海默病病例中 TFCP2 基因 A 等位基因的频率降低(比值比 = 0.59,95% CI,0.35-1.00)。然而,与对照组相比,阿尔茨海默病病例的基因型频率没有显着差异。当根据年龄、性别或 apoE4 等位基因(107741.0016)的存在调整数据时,没有发现显着影响。