BCL6 核心加压器; BCOR

KIAA1575

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包含 BCOR/CCNB3 融合基因

HGNC 批准的基因符号:BCOR

细胞遗传学定位:Xp11.4 基因组坐标(GRCh38):X:40,051,246-40,177,329(来自 NCBI)

▼ 说明

全长 BCOR 蛋白充当 BCL6(109565)的辅阻遏物,BCL6 是生发中心形成所需的 POZ/锌指转录阻遏物,并可能影响细胞凋亡(Huynh et al., 2000)。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人(2000)通过对从大小分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,克隆了 BCOR,并将其命名为 KIAA1575。RT-PCR ELISA 检测到成人肝脏、肾脏、脊髓、全脑和所有检查的特定脑区域以及胎儿肝脏中的中间 BCOR 表达。成人心脏、脾脏、卵巢以及胎儿大脑中的表达较低。在睾丸、胰腺、肺和骨骼肌中几乎没有检测到表达。

Huynh 等人(2000)使用酵母 2-杂交筛选来鉴定与 BCL6 的 POZ 结构域相互作用的蛋白质,从成熟的 B 细胞系表达文库中克隆了 BCOR。推导的 1,721 个氨基酸的蛋白质包含 3 个 C 端串联锚蛋白重复序列​​。他们将一种选择性剪接变体命名为 BCOR-S,编码推导的 1,004 个氨基酸的蛋白质,该蛋白质与最长变体直至第 999 个氨基酸相同,之后它具有独特的 5 个氨基酸 C 末端。BCOR-S 不包含锚蛋白重复序列​​。使用较长 BCOR 变体特有的探针进行 Northern 印迹分析,在 HeLa 细胞和 B 细胞系中检测到 6.5 和 7.0 kb 的转录本,表明存在第三种变体。RNA 斑点印迹分析检测到所有检查组织中 BCOR 的表达。

▼ 基因功能

Huynh 等人(2000)发现,全长 BCOR 蛋白(而非 BCOR-S)在与启动子 DNA 元件相连时充当辅阻遏物,而当过表达时,它会增强 BCL6 抑制。两种 BCOR 变体均与特定的 I 类和 II 类组蛋白脱乙酰酶(HDAC)相关,表明 BCOR 可能在功能上连接这两类 HDAC,并且组蛋白/蛋白质脱乙酰化是 BCOR 介导的抑制的机制。BCOR 选择性地与 BCL6 的 POZ 结构域相互作用,但不与测试的其他 8 个 POZ 蛋白相互作用,包括 PLZF(176797)。BCL6的POZ结构域与SMRT(600848)、NCOR(600849)和BCOR之间的相互作用是互斥的。

Junco等人(2013)利用细菌2-杂交系统发现PCGF1(610231)和PCGF3(617543)的C端泛素样折叠结构域与BCOR和BCORL1(300688)的C端结构域相互作用。

▼ 测绘

Nagase等(2000)通过辐射杂交分析将BCOR基因定位到X染色体。

Gross(2017)根据BCOR序列(GenBank AF317391)与基因组序列(GRCh38)的比对,将BCOR基因定位到染色体Xp11.4。

▼ 细胞遗传学

Pierron 等人(2012)使用高通量 cDNA 测序(RNA-seq)来研究被诊断为缺乏典型 EWSR1/ETS 易位(133450)的骨小圆细胞瘤个体的样本。在X染色体上观察到BCOR和CCNB3(300456)之间存在新的融合。RNA-seq 结果通过 RT-PCR 和肿瘤特异性基因组易位断点的克隆得到证实。在一系列 594 例肉瘤病例中总共鉴定出 24 例 BCOR/CCNB3 阳性肿瘤。基因分析实验表明,BCOR/CCNB3 阳性病例在生物学上与其他肉瘤(尤其是尤文肉瘤)不同。Pierron 等人(2012)还表明,CCNB3 免疫组织化学是该肉瘤亚组的有力诊断标志物,并且 BCOR/CCNB3 或截短的 CCNB3 的过表达会激活 NIH3T3 细胞中的 S 期。

▼ 分子遗传学

Hoefnagel et al.(1963)和Ogunye et al.(1975)最初报道的一个家庭的受影响成员患有综合征性小眼症-2(MCOPS2;Ng et al.(2004)在BCOR基因(P85L;300166)中发现了pro85到leu的突变。300485.0001)。由于该家系的小眼综合征与眼面心齿综合征(OFCD;参见300166),他们对来自7个OFCD家族的10名受影响女性的BCOR进行了测序,发现7个家族中每个家族都有不同的突变(参见300485.0002-300485.0005),所有这些突变都预测了提前终止密码子。具有 P85L 突变或 OFCD 中发现的突变的 BCOR 与 BCL6 相互作用并有效抑制转录,表明这些综合征可能是由 BCOR 替代功能的缺陷引起的,例如与 BCL6 以外的转录伙伴的相互作用。

Horn等人(2005)在3名无关的OFCD患者中发现了BCOR基因(300485.0006-300485.0008)的缺失。然而,他们没有在 3 名 Lenz 小眼综合征患者(309800)或 5 名具有与该疾病相似表型的患者中发现 BCOR 基因突变。作者得出结论,BCOR 是 OFCD 的致病基因,但不是与 Lenz 小眼综合征相关的主要基因。

Hilton等人(2009)在来自20个患有小眼球综合症的家庭的34名女性患者中鉴定出BCOR基因的杂合突变(参见例如300485.0003和300485.0010-300485.0012)。2个家庭的3名患者被发现存在马赛克;其中 1 名患者无症状,而另外 2 名患者则表现出典型的症状。此外,一名患有小眼球综合症的无亲缘关系的男孩是 P85L 突变的半合子。

Suzumori 等人(2013)在来自患有综合征性临床无眼症的日本家庭的 2 名受影响男性个体中鉴定出 BCOR 基因中 P85L 突变的半合性。

▼ 动物模型

Ng等人(2004)克隆了BCOR的斑马鱼直向同源物,发现敲除该直向同源物会引起眼睛、骨骼和中枢神经系统的发育扰动,这与人类疾病Lenz小眼症(309800)和OFCD综合征一致,证实BCOR是一种早期胚胎发生过程中的关键转录调节因子。

▼ 等位基因变异体(12个选例):

.0001 小眼症,综合症 2

BCOR、PRO85LEU

患有小眼综合症-2(MCOPS2;MCOPS2;300166),Ng et al.(2004)鉴定出BCOR基因中的254C-T转变,导致pro85到leu(P85L)突变。该家系中该突变与疾病共分离(lod = 2.46)。

Hilton et al.(2009)在一名患有小眼症、前额狭窄、单耳、房间隔缺损、多指部分并指、第五指畸形、桡尺骨性连接、智力低下和尿道下裂的7岁男孩中发现了P85L BCOR 基因突变。

Suzumori等人(2013)在2名患有综合征性临床无眼症的日本男性同父异母同胞中发现了BCOR基因中的P85L突变。母亲是 P85L 杂合携带者。第一个男孩在 6 个月大时死于心脏缺陷;在第二个受影响的个体中,产前超声检查显示胎儿眼睛发育不全,培养的羊膜细胞分析显示存在 P85L 突变。妊娠在第 19 周时终止。尸检被拒绝,但检查证实临床无眼症,并显示鼻梁凹陷和单耳。

.0002 小眼症,综合症 2

BCOR、IVS8AS、GT、-1

患有眼面心齿综合征家庭的女性(MCOPS2;300166),Ng等人(2004)在BCOR基因内含子8的剪接受体位点-1位置鉴定了G到T的转变,这预测了提前终止密码子。

.0003 小眼症,综合症 2

BCOR、ARG976TER

3名来自眼面心齿综合征家庭的受影响女性(MCOPS2;300166),Ng et al.(2004)在BCOR基因中发现了一个2926C-T转换,导致arg976到ter(R976X)突变。

Hilton等人(2009)在McGovern等人(2006)报道的患有眼面心齿综合征的母女中发现了这种突变。

.0004 小眼症,综合症 2

BCOR,1-BP DEL,3881A

2名来自眼面心齿综合征家庭的受影响女性(MCOPS2;300166),Ng 等人(2004)在 BCOR 基因 3881delA 中发现了一个 1-bp 的缺失,这预示着一个提前终止密码子。

.0005 小眼症,综合症 2

BCOR,EX9-15DEL

一名患有眼面心齿综合征家庭的受影响女性(MCOPS2;300166),Ng et al.(2004)鉴定出至少包含 BCOR 基因外显子 9-15 的大缺失,但不涉及任何其他基因。

.0006 小眼症,综合症 2

BCOR、2-BP DEL、2488AG

眼面心齿综合征患者(MCOPS2;300166),Horn et al.(2005)在BCOR基因的外显子2中发现了一个2-bp的缺失(2488_2489delAG)。患者的母亲不携带突变,父亲也无法接受检测。在 100 个对照 X 染色体中未观察到缺失。

.0007 小眼症,综合症 2

BCOR、1-BP 删除、3286G

眼面心齿综合征患者(MCOPS2;300166),Horn et al.(2005)在BCOR基因的外显子7中发现了一个1-bp的缺失(3286delG)。父母无法进行测试,并且在 100 个对照 X 染色体中未发现缺失。

.0008 小眼症,综合症 2

BCOR,60 KB 删除

眼面心齿综合征患者(MCOPS2;300166),Horn 等人(2005)在父系衍生的 BCOR 基因中鉴定出部分约 60 kb 的缺失,至少包含外显子 2 至 15。该缺失是一个从头事件。

.0009 小眼症,综合症 2

BCOR、1-BP DEL、2613C

眼面心齿综合征患者(MCOPS2;300166),Oberoi et al.(2005)描述了 BCOR 基因外显子 4 中的 1-bp 缺失(2613delC),预计会导致移码并导致蛋白质过早终止(Phe871Leufs8Ter)。(Oberoi et al 的文章.(2005),这个删除在摘要、讨论和图4中被称为2613delC,但在结果中被称为1315delC。)

.0010 小眼症,综合症 2

BCOR,EX4-15DEL

双胞胎姐妹和其中1对双胞胎的女儿均患有综合征性小眼症-2(MCOPS2;300166),Hilton等人(2009)在BCOR基因中发现了一个大的缺失,至少包含外显子4到15。这对27岁的同卵双胞胎姐妹都呈现出典型的表型,被发现是体细胞嵌合体用于删除;对于 18 个月大的女儿来说,这种缺失不是马赛克性的,她表现出一系列重叠的特征。这三人的共同特征包括先天性白内障、小眼症以及第二和第三脚趾并指。此外,双胞胎都有鼻中隔软骨、鼻梁高、脸又长又窄,而女儿则没有面部畸形。双胞胎之一患有室间隔缺损,女儿患有房间隔缺损。这对双胞胎表现出牙列延迟、乳牙持续存在和牙根肥大。女儿的乳牙列期延迟。其中一名双胞胎还患有脊柱侧弯和桡尺骨性骨联症。

.0011 小眼症,综合症 2

BCOR,EX13-14DEL

一名 14 个月大的女孩,具有典型的小眼综合症 2(MCOPS2; 300166),Hilton et al.(2009)在BCOR基因中发现了一个杂合性缺失,包含外显子13和14。PCR扩增和测序将缺失精炼至1,410 bp(c.4742-141_4976+821del1410),跨越内含子12到内含子14并预测会导致提前终止密码子(Asp1581GlyfsTer15)。先证者的无症状母亲的全景牙科X光检查结果正常,结果发现该突变呈马赛克状。

.0012 小眼症,综合症 2

BCOR、5-BP 删除、4303CCATG

Hilton等人(2009)在一位患有双侧先天性白内障和单侧小眼症的女性患者中鉴定出BCOR基因中5-bp缺失的杂合性(c.4303_4307delCCATG),导致预计会导致提前终止的移码(Pro1435LeufsTer24)。据报道,先证者的母亲也有类似的表型。进一步调查显示,先证者在青少年时期曾拔除多颗乳牙,并且还表现出第二和第三趾并指,提示轻度眼面心齿表型(MCOPS2;300166)。

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