锌指 CCHC 域包含蛋白 6;ZCCHC6

末端尿苷转移酶 7;TUT7
KIAA1711

HGNC 批准的基因符号:TUT7

细胞遗传学定位:9q21.33 基因组坐标(GRCh38):9:86,287,733-86,354,410(来自 NCBI)

▼ 说明

ZCCHC6是一种进化上保守的RNA尿苷酰转移酶(EC 2.7.7.52),通过催化mRNA的3-prime多尿苷化来标记mRNA的降解(Lim et al., 2014)。

▼ 克隆与表达

Nagase等人(2000)通过对从胎儿脑cDNA文库扩增的克隆进行测序,获得了部分ZCCHC6克隆,他们将其命名为KIAA1711。推导的 1,090 个氨基酸蛋白质包含 3 个 CCHC 锌指和一个核苷酸转移酶结构域。RT-PCR ELISA 在所有成人和胎儿组织以及所检查的特定成人大脑区域中检测到 ZCCHC6 中等表达。

Rissland等人(2007)通过HeLa细胞cDNA文库的PCR获得了全长ZCCHC6。推导的1,495个氨基酸的蛋白质包含一个N端C2H2型锌指,随后是一个核苷酸三磷酸(NTP)转移酶结构域、一个聚(A)聚合酶(PAP;参见605553)相关结构域,一个CCHC型锌指,一个第二NTP转移酶结构域,一个第二PAP相关结构域,以及靠近C末端的2个CCHC型锌指。Rissland 等人(2007)指出,其中 1 个 PAP 相关结构域可能不活跃,因为它缺乏阳离子协调所需的天冬氨酸三联体。

▼ 基因功能

人 ZCCH6 是粟酒裂殖酵母 Cid1 的直系同源物,Cid1 是一种与细胞周期检查点控制有关的推定细胞质 PAP。Rissland et al.(2007)发现,粟酒裂殖酵母Cid1除了具有PAP活性外,还具有较强的聚(U)聚合酶(PUP)活性,而聚(G)聚合酶(PGP)和聚(C)聚合酶活性较弱。 PCP)活动。从粟酒裂殖酵母中纯化的含Cid1的复合物在体外具有更强的PUP活性,但它们的PAP活性较弱。S 期停滞后,肌动蛋白 mRNA 的 3 引物末端以 Cid1 依赖性方式进行转录后尿苷化。在 293T 细胞中表达后,含有人 ZCCHC6 的复合物在体外表现出有效的 PUP 活性,但对 5-prime 标记的(A)15 的 PAP、PGP 或 PCP 活性很少。

LIN28(参见LIN28A, 611043)通过与前体(pre-)和初级(pri-)LET7 miRNA的茎环结构的末端环结合并抑制进一步成熟来抑制LET7家族microRNA(miRNA)(参见MIRLET7A1, 605386) 。Thornton et al.(2012)发现小鼠Lin28在体外通过与小鼠Zcchc11(613692)和/或人ZCCHC6相互作用并增强它们对前Let7 3-prime末端的寡尿苷化来下调Let7。Lin28 以剂量依赖性方式增强两种酶的尿苷化作用。通过小干扰 RNA 去除胚胎细胞中的 Zcchc11 和/或 Zcchc6 结果表明,这些酶过度下调了 Let7 mRNA。两种酶的敲低比单独敲低任一酶更显着地上调成熟的 Let7。

Lim et al.(2014)在体外和HeLa细胞中发现纯化的人TUT7(ZCCHC6)和TUT4(ZCCHC11)选择性识别和尿苷化短A尾(小于25个核苷酸)的RNA,表明脱腺苷酸化后可能发生尿苷化。在HeLa细胞中,TUT4和TUT7被耗尽,但TUT2未被耗尽(PAPD4;614121),绝大多数mRNA丢失了oligo(U)尾,半衰期延长。抑制多种衰变途径中的 mRNA 衰变因子导致寡(U) mRNA 的积累。Poly(A)识别孤立于3-prime UTR 序列。重组PAP酶PABPC1(604679)拮抗poly(A)mRNA的尿苷化,可能有助于TUT4和TUT7对短A尾的特异性。miRNA MIR1 的模拟物(参见 609326)诱导其 mRNA 靶标的尿苷化,并且需要 TUT4 和 TUT7 来增强 MIR1 靶标的衰减。突变分析表明,TUT7 的 C 端一半足以识别和尿苷酸化具有少于 25 个核苷酸的多聚腺苷酸尾的单链 RNA。Lim et al.(2014)得出结论,TUT4和TUT7可能在去腺苷酸化mRNA的尿苷化中发挥冗余作用,并且mRNA的3-prime尿苷化充当全局mRNA衰变的分子标记。

Morgan等人(2017)表明,TUT4和TUT7介导的mRNA的3-prime末端尿苷化通过消除卵母细胞生长过程中的转录本来塑造小鼠母体转录组。TUT4 和 TUT7 介导的尿苷化对于卵母细胞成熟和生育能力至关重要。与体细胞相比,卵母细胞转录组具有较短的聚腺苷酸尾和较高的末端寡尿苷化相对比例。TUT4 和 TUT7 的删除会导致一组转录物的积累,这些转录物具有高频率的非常短的聚(A)尾,以及 3-prime 寡尿苷化的丢失。相比之下,TUT4 和 TUT7 的缺陷不会改变多种体细胞中的基因表达。总之,Morgan等人(2017)表明,poly(A)尾长和3-prime末端尿苷化在塑造功能性母体转录组方面具有重要且特定的功能。

▼ 测绘

Nagase等人(2000)通过对人类-啮齿动物杂交组的PCR,将ZCCHC6基因定位到染色体9。

Hartz(2015)根据ZCCHC6序列(GenBank AK023471)与基因组序列(GRCh38)的比对,将ZCCHC6基因定位到染色体9q21.33。

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