转换因子相关蛋白复合物 5, σ-1 子单元; AP5S1
染色体 20 开放解读码组 29; C20ORF29
σ5
HGNC 批准的基因符号:AP5S1
细胞遗传学定位:20p13 基因组坐标(GRCh38):20:3,820,547-3,828,838(来自 NCBI)
▼ 说明
AP5S1 是转换因子蛋白复合物-5 的一个小子单元(Hirst et al., 2011)。
▼ 克隆与表达
Hirst 等人(2011)确定推导的 200 个氨基酸的 AP5S1 蛋白(他们称之为 C20ORF29)具有与转换因子蛋白复合物相关的 σ 子单元相似的 α 螺旋和 β 链结构。荧光标记的C20ORF29在HeLa细胞中表达时与溶酶体膜蛋白LAMP1(153330)有很大程度的重叠。
▼ 基因功能
Slabicki等(2010)通过对HeLa细胞进行免疫沉淀分析,发现C20ORF29存在于包含SPG11(610844)、SPG15(ZFYVE26;612012)、KIAA0415(AP5Z1;613653)、DKFZp761E198(AP5B1;614367)。HeLa 细胞中 KIAA0415、C20ORF29 或 SPG15 的敲低会减少测试底物中的同源重组,而 SPG11 或 DKFZp761E198 的敲低则没有效果。
Hirst et al.(2011)发现HeLa细胞中C20ORF29的敲低引起内体标志物CIMPR(IGF2R;IGF2R;147280)和VPS26(VPS26A;605506)从小的细胞质焦点到更大的核周斑点。
▼ 测绘
Hartz(2012)根据AP5S1序列(GenBank AK002030)与基因组序列(GRCh37)的比对,将AP5S1基因定位到染色体20p13。