CUGBP 和 ELAV 家族,成员 4;CELF4
CUGBP 和 ETR3 样因子 4
布鲁诺式 4; BRUNOL4
HGNC 批准的基因符号:CELF4
细胞遗传学定位:18q12.2 基因组坐标(GRCh38):18:37,242,844-37,565,798(来自 NCBI)
▼ 说明
CELF 家族的成员,例如 CELF4,在共转录和转录后 RNA 加工中发挥各种作用。所有 CELF 蛋白似乎都会影响前 mRNA 剪接,但各个 CELF 在调节 mRNA 稳定性和转录方面具有不同的作用(Wagnon 等人总结,2012)。
▼ 克隆与表达
通过在数据库中搜索与非洲爪蟾Brunol1(TNRC4;TNRC4;612678),随后通过基因组序列分析,Good et al.(2000)鉴定出了BRUNOL4。推导的蛋白质包含2个N端RNA识别基序(RRM)、一个长连接区和一个C端RRM。Good等人(2000)还鉴定了BRUNOL4剪接变体,其编码的蛋白质缺少第三个RRM的20或48个氨基酸。
Ladd等人(2001)通过在EST数据库中搜索与CUGBP(601074)相似的序列,然后对人脑cDNA文库进行PCR,克隆了BRUNOL4,他们将其命名为CELF4。除了 3 个 RRM 之外,推导的 486 个氨基酸的 CELF4 蛋白还包含多个潜在的磷酸化位点和 C 末端附近的共有核定位信号。成年小鼠组织的蛋白质印迹分析检测到多种 CELF4 同工型,主要在骨骼肌和大脑中表达。
Ladd et al.(2004)利用RNA斑点印迹分析发现CELF4在所有成人和胎儿人体组织中表达,其中在整个大脑和腺体组织中表达最高。在心脏、骨骼肌和肝脏中表达中等,在所有其他检查组织中表达较低。
Yang等人(2007)利用Northern blot分析发现Brunol4在成年小鼠大脑中高表达。原位杂交显示Brunol4在海马表达最强,在大脑皮层、嗅球和小脑颗粒细胞层表达较低。在海马内,CA2 和 CA3 区域的锥体神经元中检测到最高表达。
Wagnon et al.(2012)发现,Celf4 在皮质小鼠脑裂解物的多核糖体部分富集,但在突触体部分富集。免疫组织化学分析显示,几个小鼠大脑区域的细胞体和近端突起中存在 Celf4,但突触中不存在 Celf4。
▼ 测绘
Good等(2000)通过基因组序列分析,将BRUNOL4基因定位到染色体18q12。
Yang et al.(2007)将Celf4基因定位到小鼠染色体8。
▼ 基因功能
Ladd et al.(2001)表明,所有人类CELF蛋白,包括CELF4,都结合含有肌肉特异性剪接增强子(MSE)元件的RNA,并能激活心肌肌钙蛋白T(TNNT2;TNNT2;MSE依赖性外显子包含)。191045)转染鹌鹑成纤维细胞中的小基因。
通过分析与 Celf4 交联的 mRNA,Wagnon 等人(2012)确定 Celf4 与野生型老鼠大脑中至少 15% 的转录组相互作用。Celf4 对目标转录本的 3-prime UTR 表现出特异性,并主要结合(A/U)UGU 基序。野生型和 Celf4 缺陷小鼠大脑结合的转录本的比较表明,Celf4 控制多种转录本,对膜相关突触蛋白和突触可塑性调节因子(包括转运蛋白和离子通道以及细胞粘附分子)具有显着影响。Celf4 不会改变剪接模式,但似乎可以调节 mRNA 表达、转录和定位。
▼ 动物模型
Yang等人(2007)描述了转基因小鼠中的一种突变,称为飞行常客(Ff),从3个月大时开始就表现出基因型、年龄和品系依赖性的神经系统特征的严重程度。缺陷包括常规处理时反复出现的边缘和强直阵挛发作、尖波放电、站立和跌倒以及随后的奔跑和弹跳阶段,该突变被命名为该阶段。在C57BL/6L背景下,纯合(Ff/Ff)突变小鼠围产期死亡。Ff/+杂合子也表现出多动症并出现迟发性肥胖,但他们的寿命正常。Ff/Ff 和 Ff/+ 突变体均未表现出异常的脑形态。Yang等人(2007)将Ff突变鉴定为转基因插入到Brunol4基因的内含子1中,预计它会干扰Brunol4剪接。RT-PCR 检测到 Ff/Ff 脑中没有 Brunol4 转录本,并且 Ff/+ 脑中 Brunol4 减少了 45%。对 Ff/Ff 新生儿的微阵列分析显示 94 个转录本下调,包括 Brunol4 本身和 4 个已知或预测与神经兴奋性相关的基因:Htr2c(312861)、Syn2(600755)、Nsf(601633)和 Snca(163890)。
Wagnon et al.(2011)发现小鼠中 Celf4 的敲除会导致与 Ff 小鼠相似的遗传复杂的癫痫症。Celf4等位基因的空间和时间条件敲除表明,出生后第一周内删除Celf4会导致失神样非惊厥性癫痫发作,而成年小鼠中删除Celf4会导致惊厥性癫痫发作。从大脑皮层和海马兴奋性神经元中选择性删除 Celf4 会降低癫痫阈值并促进自发性惊厥。从抑制性神经元中删除 Celf4 似乎会增加癫痫阈值。免疫组织化学分析显示,Celf4 主要在大脑皮层、海马、纹状体和网状丘脑的兴奋性神经元中表达。皮质第五层锥体神经元的膜片钳记录显示,Celf4 缺失增加了反应频率和幅度,表明 Celf4 缺陷小鼠改变了兴奋性而非抑制性神经传递。