NMDA 受体调节 2; NARG2
HGNC 批准基因符号:ICE2
细胞遗传学定位:15q22.2 基因组坐标(GRCh38):15:60,419,609-60,479,142(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Sugiura et al.(2001)克隆了小鼠Narg2。Northern印迹分析检测到肾脏和睾丸中的表达最高,而在其他检查组织中的表达要弱得多。Sugiura et al.(2004)获得了全长的小鼠Narg2 cDNA和缺少外显子12的剪接变体。推导的全长988个氨基酸的蛋白质具有(S/T)Pxx的重复,这是一个推定的DNA-结合域,并且它在 C 末端附近有一个假定的核定位信号。通过数据库分析,Sugiura et al.(2004)鉴定出了人类NARG2。推导的 982 个氨基酸的蛋白质与小鼠 Narg2 具有 74% 的同一性。Sugiura et al.(2004)还发现了一个选择性剪接的人类 NARG2 转录本,该转录本缺乏外显子 4 和 5。在酵母、线虫、果蝇或鱼类数据库中未发现 NARG2 直向同源物。对人体组织的 Northern 印迹分析检测到,NARG2 在胎儿肾脏、肝脏、肺和脑以及成人睾丸中显着表达,但在成人对应物或检查的其他成人组织中很少或没有表达。表位标记的Narg2定位于转染的大鼠肾成纤维细胞的细胞核。
▼ 基因功能
Sugiura et al.(2001)利用cDNA芯片分析发现,Nmda受体基因(见GRIN1;138249)已被删除。野生型新生小鼠的原位杂交表明,所有 3 个基因在神经元增殖和迁移区域均高表达,并且在出生后早期发育过程中表达下调。Northern印迹分析检测到这些基因在胚胎第13天低表达,在出生后第0天高表达,此后表达非常低。Sugiura等人(2004)利用Northern印迹分析和RNase保护测定,发现在分裂和未成熟的胚胎癌细胞系中Narg2高表达。视黄酸诱导神经元分化后,Narg2 表达下调。
▼ 基因结构
Sugiura et al.(2004)确定NARG2基因包含16个外显子,跨度约28 kb。
▼ 测绘
Sugiura等(2004)通过基因组序列分析,将NARG2基因定位到染色体15q21.3;通过同样的方法,他们将小鼠Narg2基因定位到染色体9D上的同线性同源区域。Sugiura et al.(2004)还在染色体 4 上鉴定了 2 个不完整串联的 NARG2 假基因,在染色体 3 上鉴定了全长 NARG2 假基因。