溶质载体家族 38(氨基酸转运蛋白),成员 4; SLC38A4
中性氨基酸转运蛋白 3; NAT3
N-系统氨基酸转运蛋白3
氨基酸转运蛋白 A3; ATA3
HGNC 批准的基因符号:SLC38A4
细胞遗传学位置:12q13.11 基因组坐标(GRCh38):12:46,764,761-46,832,431(来自 NCBI)
▼ 说明
SLC38A4 主要存在于肝脏中,转运阳离子和中性氨基酸。 SLC38A4 的阳离子氨基酸转运不依赖于 Na(+) 和 pH 值,而中性氨基酸的转运则依赖于 Na(+) 和 pH 值(Hatanaka et al., 2001)。
▼ 克隆与表达
Hatanaka 等人使用大鼠 Ata3 作为探针(2001) 从肝癌细胞系 cDNA 文库中克隆了 SLC38A4,并将其命名为 ATA3。推导的 547 个氨基酸的蛋白质包含 10 或 11 个跨膜结构域。 ATA3 与大鼠 Ata3 具有 88% 的氨基酸同一性,与 ATA1(SLC38A1)、ATA2(SLC38A2;605180)、SN1(SLC38A3;604437) 和 SN2(SLC38A5;300649) 具有 47% 至 57% 的同一性。对几种组织的 Northern 印迹分析检测到几乎仅在肝脏中表达的 4.0-kb 转录物;在肾脏中检测到低得多的表达。
Gu等人通过在数据库中搜索与小鼠Nat(SCN11A;604385)和人SLC38A3相似的序列,然后对乳腺癌细胞系cDNA文库进行文库筛选和巢式PCR(2001) 克隆了 SLC38A4,他们将其命名为 NAT3。推导的 547 个氨基酸的蛋白质包含 10 个假定的跨膜结构域,并且缺乏信号肽。 NAT3 和小鼠 Nat 具有 55% 的氨基酸同一性。肝癌和乳腺癌细胞系的 Northern 印迹分析检测到 4.0-kb 转录本。 RT-PCR 检测到 NAT3 在成人和胚胎肝脏中高表达,在肌肉、肾脏和胰腺中表达较低,在胎盘和心脏中微量表达。转染到非洲爪蟾卵母细胞中的NAT3在质膜上表达。
▼ 基因功能
Hatanaka 等人通过视网膜色素上皮细胞的功能表达(2001) 发现 ATA3 介导高亲和力、不依赖 Na(+) 的阳离子氨基酸转运,类似于系统 y(+)L 转运蛋白(参见 604235)。精氨酸的吸收是饱和的,并且发生在 5.5 至 9.0 范围内的所有 pH 值下。 ATA3 还表现出所有测试的中性氨基酸的低亲和力、Na(+) 偶联转运,包括 α-(甲基氨基) 异丁酸(MeAIB),系统 A 的模型底物。甘氨酸的转运表现出 pH 依赖性,最大转运pH 值 8.5。由于肝脏不表达其他高亲和力阳离子氨基酸转运蛋白,Hatanaka 等人(2001) 假设 ATA3 可能提供肝脏摄取精氨酸的主要途径。
顾等人(2001) 发现用 NAT3 转染的非洲爪蟾卵母细胞表现出低亲和力的丙氨酸转运。转移依赖于 Na(+) 和 pH 值。丙氨酸转运在较高 pH 下增加,与氮系统转运蛋白一样,Li(+) 可以部分替代 Na(+)。 NAT3 还转运组氨酸、谷氨酰胺和赖氨酸。通过竞争测定,Gu 等人(2001) 发现丙氨酸转运被几种阳离子和中性氨基酸显着抑制,但 MeAIB 则不然。
▼ 基因结构
畠中等人(2001)和顾等人(2001) 确定 SLC3A4 基因包含 16 个外显子,跨度至少 40 kb。外显子 1 未翻译。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Hatanaka 等人(2001) 将 SLC38A4 基因定位到染色体 12q13。顾等人(2001)通过电子PCR和FISH将SLC38A4基因定位到染色体12q12-q13。