异质核核糖核蛋白 A0; HNRNPA0
HNRPA0
HGNC 批准的基因符号:HNRNPA0
细胞遗传学位置:5q31.2 基因组坐标(GRCh38):5:137,745,651-137,754,363(来自 NCBI)
▼ 说明
异质核RNA(hnRNA) 的加工是由称为异质核核糖核蛋白(hnRNP) 复合物的大蛋白-RNA 复合物介导的。至少 20 种主要蛋白质和许多不太丰富的蛋白质已被电泳鉴定为 hnRNP 复合蛋白。 HNRNPA0 是这些蛋白质主要类别 A/B 家族的成员,其典型特征是包含 2 个 RNA 结合结构域和紧接着富含甘氨酸的 C 末端的特征性一级结构(Myer 和 Steitz 总结,1995)。
▼ 克隆与表达
Li 等人通过使用 CCG 重复寡核苷酸探针筛选人脑 cDNA 文库(1993) 鉴定了编码 HNRPA0 的部分克隆。 Northern 印迹分析检测到人额叶大脑皮层和小脑皮层中 4.5 kb HNRPA0 转录物的表达。
在尝试分离与 mRNA 不稳定性有关的 AUUUA 结合蛋白时,Myer 和 Steitz(1995) 分离出了一种新的低丰度 hnRNP 蛋白。肽测序显示分离的蛋白质与 Li 等人先前分离的部分 HNRPA0 cDNA 相同(1993)。 Myer 和 Steitz(1995) 随后从人胎盘 cDNA 文库中克隆了全长 HNRPA0,并确定 HNRPA0 编码 305 个氨基酸的蛋白质,预测分子量为 31.7 kD。 HNRPA0 包含 2 个 RNA 结合结构域,后面是富含甘氨酸的 C 末端。 HNRPA0 蛋白与 hnRNPA1(164017) 和 A2(参见 600124)分别具有 58% 和 64% 的相似性。 Northern印迹分析显示在外周血白细胞、结肠、小肠、卵巢、睾丸、前列腺、胸腺和脾中表达1.7和2.8kb的2个HNRPA0转录物。 2 个 HNRPA0 转录物的比例在测试的组织中有所不同。
▼ 基因功能
通过 HNRPA0 与抗 HNRNPA1、HNRNPC1/C2(164020) 和 HNRNPU(602869) 的抗体进行共免疫沉淀,Myer 和 Steitz(1995) 表明 HNRPA0 与 HNRNP 复合物相关。体外交联实验表明HNRPA0蛋白与AUUUA元件结合。
赖等人(2001) 鉴定了 HNRPA0 基因内的 3 个聚腺苷酸化位点,利用这些位点生成 1.7、2.8 和 3.9 kb 的 3 种 RNA 亚型。
▼ 基因结构
赖等人(2001) 确定 HNRNPA0 基因是无内含子的并且跨度为 3.9 kb。
▼ 测绘
赖等人(2001) 生成了染色体 5q31 内 1.5 Mb 区域的转录图谱,并将 HNRNPA0 基因定位在 D5S479 和 D5S500 之间。