犰狳重复蛋白 2; ARMC2
HGNC 批准的基因符号:ARMC2
细胞遗传学位置:6q21 基因组坐标(GRCh38):6:108,848,422-109,053,040(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
库顿等人(2019) 指出 ARMC2 基因编码预测的 867 个氨基酸的蛋白质。它是一种犰狳蛋白,由 12 个犰狳重复序列组成,两侧是独特的 N 端和 C 端结构域。通过 RT-qPCR,Coutton 等人(2019) 发现睾丸中 ARMC2 的表达显着高于其他 6 种测试的人体组织。
▼ 基因结构
库顿等人(2019)指出ARMC2基因包含18个外显子。
▼ 测绘
库顿等人(2019) 指出 ARMC2 基因对应到 6 号染色体。
Gross(2019) 根据 ARMC2 序列(GenBank BC030603) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 ARMC2 基因对应到染色体 6q21。
▼ 分子遗传学
Coutton 等人在 168 名患有原发性不孕症且精子鞭毛存在多种形态异常的男性中,有 5 名患有原发性不孕症(2019) 鉴定了 ARMC2 基因(618424.0001-618424.0005) 突变的纯合性,这些突变在对照或公共变异数据库中未发现;参见生精衰竭-38(SPGF38;618433)。人类和小鼠精子的免疫荧光研究显示,轴丝蛋白 SPAG6(605730) 和 Spef2(610172) 分别缺失,表明 ARMC2 可能特异性参与轴丝中央对复合物的组装或稳定性。
▼ 动物模型
Coutton 等人利用 CRISPR/Cas9 技术(2019) 生成了 Armc2 -/- 小鼠,并观察到纯合雄性完全不育,而纯合雌性完全可育。对突变雄性附睾精子的分析表明,100% 的附睾精子具有短、粗和/或卷曲的鞭毛,与完全运动缺陷相关。精子浓度降低至野生型同窝仔鼠的 25% 以下。轴丝的免疫荧光分析表明完全不存在 Spef2(610172),这是中央对复合物的标记。
▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):
.0001 生精失败 38
ARMC2、IVS8DS、G-A、+1
在一名因鞭毛(SPGF38;618433)多种形态异常而患有原发性不育的男性(ARMC2_1)中,Coutton 等人(2019) 鉴定了 ARMC2 基因内含子 8 中剪接突变(c.1023+1G-A, NM_03131.5) 的纯合性。 RT-PCR 和对患者精子细胞 RNA 的测序表明,外显子 8 发生跳跃,导致移码,导致过早终止密码子(Glu283AlafsTer2)。在内部对照或 dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组变异服务器或 gnomAD 数据库中未发现该突变。
.0002 生精失败 38
ARMC2、ILE760ASN
在一名因鞭毛(SPGF38;618433)多种形态异常而患有原发性不育的男性(ARMC2_2)中,Coutton 等人(2019) 鉴定了 ARMC2 基因外显子 16 中 c.2279T-A 颠换(c.2279T-A, NM_032131.5) 的纯合性,导致保守残基处 ile760 到 asn(I760N) 取代。在内部对照或 dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组变异服务器或 gnomAD 数据库中未发现该突变。
.0003 生精失败 38
ARMC2、2-BP DEL、2353TT
在一名因鞭毛(SPGF38;618433)多种形态异常而患有原发性不育的男性(ARMC2_3)中,Coutton 等人(2019) 鉴定了 ARMC2 基因外显子 17 中 2 bp 缺失(c.2353_2354delTT, NM_032131.5) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Leu785MetfsTer5)。在内部对照或 dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组变异服务器或 gnomAD 数据库中未发现该突变。
.0004 生精失败 38
ARMC2、5-BP DEL、1284ACAAA
在一名因鞭毛(SPGF38;618433)多种形态异常而患有原发性不育的男性(ARMC2_4)中,Coutton 等人(2019) 鉴定了 ARMC2 基因外显子 10 中 5 bp 缺失(c.1284_1288delACAAA, NM_032131.5) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Lys428AsnfsTer3)。在内部对照或 dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组变异服务器或 gnomAD 数据库中未发现该突变。
.0005 生精失败 38
ARMC2、GLN141TER
在一名因鞭毛(SPGF38;618433)多种形态异常而患有原发性不育的中国男性(ARMC2_5)中,Coutton 等人(2019) 鉴定了 ARMC2 基因外显子 4 中 c.421C-T 转换(c.421C-T, NM_032131.5) 的纯合性,导致 gln141 到 ter(Q141X) 取代。他的表亲父母是杂合突变,在他的可生育兄弟、内部对照、dbSNP、1000 基因组计划、NHLBI 外显子组变异服务器或 gnomAD 数据库中都没有发现这种突变。