TAF12 RNA 聚合酶 II,TATA 框结合蛋白相关因子,20-KD; TAF12
TATA 框结合蛋白相关因子 2J; TAF2J
TBP 相关因子,RNA 聚合酶 II,20-KD; TAFII20
HGNC 批准的基因符号:TAF12
细胞遗传学位置:1p35.3 基因组坐标(GRCh38):1:28,602,850-28,648,269(来自 NCBI)
▼ 说明
RNA 聚合酶 II(参见 180660)对转录的控制涉及基础转录机制,这是一组蛋白质,包括 TFIIB(TF2B;189963)、TFIIE(参见 189962)、TFIIF(参见 189968)、TBP(600075)、TFIIA 和 TAFII250(TAF2A;313650)。它们与 RNA 聚合酶 II 一起组装成复合物,并受到反式激活蛋白的调节,反式激活蛋白与位于转录起始位点附近的顺式调控元件结合。一些调节剂直接与基础复合物相互作用,而另一些调节剂可能充当桥接蛋白,将反式激活因子与基础转录因子连接起来。其中一些相关因子的附着力较弱,而另一些则与 TFIID 复合物中的 TBP 紧密相关。后者包括 TAF 蛋白。 TFIID 复合物的 TAF 成分已从果蝇细胞和 HeLa 细胞中进行了表征,并且许多相关的 cDNA 已被克隆。预计不同的 TAF 会介导各种基因启动子和 RNA 聚合酶的不同转录激活子的功能。
▼ 克隆与表达
蒙格斯等人(1995) 使用由纯化的 TAF2J 肽序列(也称为 TAFII20)设计的 2 个寡聚物探针来筛选 HeLa cDNA 文库。推导的TAFII20 cDNA序列长161个氨基酸,编码20.7 kD的蛋白质,与胰蛋白酶肽序列一致。人类序列与果蝇 TAFII30α 具有 53% 的同一性。作者证明 TAFII20 直接与 TBP 以及 TAFII28(TAF2I; 600772) 和 TAFII30(TAF2H; 600475) 相互作用。
▼ 生化特征
冷冻电子显微镜
比尼奥塞克等人(2013) 展示了人类核心-TFIID 复合物的结构,由 TAF4(601796)、TAF5(601787)、TAF6(602955)、TAF9(600822) 和 TAF12 各 2 个拷贝组成,通过冷冻电子显微镜在 11.6-埃分辨率。该结构揭示了 2 倍对称、交错的结构,具有明显的突起,容纳了 TAF 的所有保守结构特征,包括组蛋白折叠。比尼奥塞克等人(2013) 进一步证明,1 TAF8(609514)-TAF10(600475) 复合物的结合破坏了核心-TFIID 的原始对称性。比尼奥塞克等人(2013) 提出,通过增加剩余的 TAF 和 TBP 各 1 个拷贝,由此产生的不对称结构可作为功能支架来使 Holo-TFIID 组装成核。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 TAF12(TAF2J) 基因测绘到 1 号染色体(SGC30964)。