囊泡转运 1; VTA1

6 号染色体开放解读码组 55； C6ORF55
SKD1-结合蛋白1； SBP1
裂解物相互作用蛋白 5； LIP5
VTA1，酵母，
的同源物 多巴胺反应基因 1； DRG1

HGNC 批准的基因符号：VTA1

细胞遗传学位置：6q24.1-q24.2 基因组坐标（GRCh38）：6:142,147,263-142,224,685（来自 NCBI）

▼ 说明

C6ORF55 编码参与多泡体转移的蛋白质，多泡体是参与分选膜蛋白以在溶酶体中降解的内体区室（Ward 等，2005）。

▼ 克隆与表达

Shi等人利用消减杂交技术鉴定大鼠脑星形胶质细胞中多巴胺上调的基因，然后筛选人胎脑cDNA文库（2001）克隆了C6ORF55。该转录本包含一个编码聚谷氨酰胺的新型（CAG）n 重复序列。

Tchernev 等人使用酵母 2-杂交分析来筛选人类 cDNA 文库中编码 LYST（606897） 相互作用蛋白的基因（2002）克隆了C6ORF55，他们将其称为LIP5。

Fujita 等人使用 Skd1（VPS4B；609983）作为小鼠脑 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中的诱饵（2004） 克隆了 C6orf55，他们将其称为 Sbp1。通过数据库分析，他们鉴定了多个与SBP1相对应的人类cDNA，其中2个编码307个和282个氨基酸的蛋白质，分别命名为DRG1和LIP5，它们的前157个氨基酸相同，但C末端不同。藤田等人（2004） 表明这些 cDNA 由于小的序列改变而不是选择性剪接而编码不同的蛋白质。推导的 309 个氨基酸的小鼠蛋白包含 N 端和 C 端卷曲螺旋结构域。 SBP1的N端区域富含碱性氨基酸，而C端区域是酸性的。 Northern印迹分析检测到大多数小鼠组织中都有Sbp1表达，其中心脏、大脑、肝脏和肾脏中的水平最高。 HeLa 细胞的免疫荧光分析表明，内源性人 SBP1 定位于细胞质。

通过序列分析，Ward 等人（2005）确定编码282个氨基酸的LIP5 cDNA包含移码，并且全长LIP5蛋白包含307个氨基酸。 COS-7 细胞的细胞分级分离和蛋白质印迹分析表明，表位标记的 LIP5 主要存在于胞质中。

▼ 基因功能

通过酵母 2-杂交分析和 Pull-down 测定，Fujita 等人（2004） 表明小鼠 Sbp1 的 C 末端区域结合 Skd1。 ATPase 阴性小鼠 Skd1 突变体在 HeLa 细胞中的表达将内源性 SBP1 和 SKD1 从细胞质重定向到源自早期和晚期内体和溶酶体的异常内体结构。在对照 HeLa 细胞中，SKD1 作为单体存在，SBP1 形成寡聚蛋白复合物。当在 HeLa 细胞中表达时，ATPase 阴性 Skd1 突变体与内源性 SBP1 和 SKD1 形成大的异源寡聚体，表明 SKD1 的 ATPase 活性是 SBP1/SKD1 复合物分解所必需的。

Ward 等人使用亲和纯化实验（2005） 表明 LIP5 与 CHMP5（610900） 特异性相互作用。小干扰 RNA 消耗 LIP5 不会改变 HeLa 和 293T 细胞中早期或晚期内吞标记物的分布，但它改变了 EGFR（131550） 转移并减少了溶酶体中的 EGFR 降解。感染人类免疫缺陷病毒（HIV）-1 的 293T 细胞中 LIP5 的消耗减少了感染性颗粒的释放。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Fujita 等人（2004） 将 C6ORF55 基因定位到 6 号染色体。