平滑肌和内皮细胞富集的迁移/分化相关的长非编码RNA; SENCR

长非编码 RNA 9；lncRNA9

HGNC 批准的基因符号：SENCR

细胞遗传学位置：11q24.3 基因组坐标（GRCh38）：11:128,691,672-128,696,023（来自 NCBI）

▼ 说明

SENCR 是一种人类特异性、富含血管细胞的长非编码 RNA（lncRNA），参与维持血管内皮细胞（EC） 的膜稳态（Lyu et al., 2019）。

▼ 克隆与表达

Bell 等人使用 RNA 测序（2014） 在人类冠状动脉平滑肌细胞（HCASMC） 中上调的一组 lncRNA 中发现了 SENCR。他们鉴定了 SENCR 的 2 个剪接变体，这两种变体都具有较低的蛋白质编码潜力。人脐静脉内皮细胞（HUVEC） 的 Northern 印迹分析检测到变体 1 约为 1 kb，变体 2 缺乏外显子 2，约为 0.5 kb。 RT-PCR 显示 SENCR 在 HCASMC、HUVEC 以及人动脉、心脏、肺、皮肤和骨骼肌中表达显着，而在其他检查组织中的表达要低得多。变体 1 的表达范围比变体 2 更广泛。 SENCR 的直向同源物仅在人类和黑猩猩谱系中发现。 RNA FISH 在 HUVEC 和 HCASMC 的细胞质中检测到 SENCR，但在 HeLa 细胞中未检测到。

▼ 基因功能

贝尔等人（2014） 发现 SENCR 的敲低对其重叠基因 FLI1（193067） 的表达影响很小。 FLI1 的敲低对 SENCR 表达影响很小。然而，SENCR 的敲除对 HCASMC 中数百个其他基因的表达产生显着影响。一些平滑肌细胞收缩基因的表达在 mRNA 和蛋白质水平上均减少，而一些与细胞迁移相关的基因的表达增加。 SENCR 的敲低会损害 HCASMC 的收缩表型，并导致其在划伤试验和博伊登室试验中过度运动。贝尔等人（2014） 的结论是，虽然 SENCR 对局部基因表达几乎没有顺式作用，但它可能在细胞质中发挥作用，在转录后水平调节血管平滑肌细胞基因表达。

吕等人（2019） 发现层流剪切应力会诱导人内皮细胞中 SENCR RNA 的升高。 HUVEC 中 SENCR 的敲低会损害 EC 膜的完整性，并使 CDH5（601120） 内化，CDH5（601120） 是细胞质中粘附连接的重要元件。 SENCR 直接与 CKAP4（618595） 相互作用，CKAP4（618595） 是一种 EC 质膜蛋白，与细胞间粘附密切相关的蛋白质相关，例如 CDH5 和 CTNND1（601045）。 SENCR 敲低将 CKAP4 重新分配到细胞表面并增强其与 CDH5 的相互作用。 CKAP4 和 CDH5 之间的细胞表面相互作用似乎取代了 CTNND1，后者将 CDH5 锚定到粘附连接处。 CKAP4-CDH5 相互作用的增强阻止了 CDH5 在 EC 膜上的正常定位，导致粘附连接缺陷并导致 EC 通透性升高。吕等人（2019） 得出的结论是，SENCR 通过与 CKAP4 相互作用，在维持 EC 粘附连接完整性方面发挥着关键作用，CKAP4 稳定了 CDH5 在细胞膜上的定位。

▼ 基因结构

贝尔等人（2014） 确定 SENCR 基因包含 3 个外显子，跨度约为 2 kb。

▼ 测绘

贝尔等人（2014） 确定 SENCR 基因对应到染色体 11q24.1，在反义方向与 FLI1 基因的 5 素端重叠。