晚期角质化包膜蛋白1A; LCE1A

晚期包膜蛋白 1; LEP1

此条目中涉及的其他实体:
包含晚期玉米化包膜基因簇
LCE 基因簇,包括

HGNC 批准的基因符号:LCE1A

细胞遗传学位置:1q21.3 基因组坐标(GRCh38):1:152,827,473-152,828,097(来自 NCBI)

▼ 说明

LCE1A属于染色体1上表皮分化复合体(EDC)内的晚期角质化包膜(LCE)基因簇。LCE簇包含多个编码角质层蛋白的保守基因,这些基因在胎儿皮肤组装过程中表达相对较晚角化信封(Jackson 等,2005)。有关 LCE 基因簇的更多信息,请参阅下面的基因家族。

▼ 克隆与表达

Marshall 等人通过数据库分析来鉴定编码晚期包膜蛋白(LEP) 的小鼠基因的人类直系同源物(2001) 鉴定出人类 LCE1A,他们将其称为 LEP1。 RT-PCR 分析在人类皮肤中检测到 LEP1,但在心脏或食道中未检测到。小鼠胚胎的原位杂交显示,第1组LEP基因,例如Lep1,在表皮屏障形成模式中的屏障形成之前表达。

Jackson 等人使用实时 PCR(2005) 发现 LCE1A 与其他 LCE1 基因一样,主要在人类胎儿、手臂、阴茎和腹部皮肤中表达。在外阴、舌头和食道中几乎没有检测到 LCE1A 表达。

▼ 基因功能

杰克逊等人(2005) 表明,在培养的正常人角质形成细胞中,LCE1 基因(包括 LCE1A)的表达在紫外线照射下上调,但钙照射却没有上调。

▼ 基因结构

杰克逊等人(2005) 确定 LCE1A 基因与大多数 LCE 基因一样,包含 2 个外显子。外显子 1 是非编码的。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Marshall 等人(2001) 将 LCE1A 基因定位在染色体 1q21 上的 LCE 基因簇内。杰克逊等人(2005) 指出,小鼠 Lce1a 基因对应到染色体 3F1 上的同线 LCE 基因簇。

▼ 基因家族

LCE基因簇

杰克逊等人(2005) 指出,LCE 基因簇在染色体 1q21 上的 EDC 内跨越超过 320 kb,根据染色体位置和蛋白质同源性,可分为 3 个基因组,分别称为 LCE1、LCE2 和 LCE3。 LCE1、LCE2 和 LCE3 子簇散布有 2 个单独的 LCE 基因、LCE4A(612618) 和 LCE5A(612619)、4 个 LCE 假基因和几个非 LCE 基因。 LCE 基因似乎是由基因扩增产生的。 Jackson 等人使用实时 PCR(2005) 发现 LCE1 和 LCE2 基因在皮肤中表达,而 LCE3 基因在所有测试的屏障形成上皮细胞(包括内部上皮细胞)中显示出低水平的组织特异性表达。 LCE基因以群体特异性方式对钙和紫外线做出反应,钙导致LCE2基因上调,紫外线导致LCE1和LCE2基因上调。

德古兹曼·斯特朗等人(2010) 使用计算方法来识别 EDC 中的保守非编码元件(CNE),以了解其调节功能。 EDC基因在胚胎皮肤发育过程中的协调表达以及多种哺乳动物(胎盘和有袋动物)基因组中EDC基因座的惊人程度的同线性和线性表明EDC中存在进化保守的调节环境。通过比较基因组学鉴定的 CNE 在分化或增殖条件下表现出动态调节活性(增强子或阻遏子)。表皮特异性、体内发育增强子活性(DNaseI 和转基因小鼠测定)在 CNE 中得到证实,包括银屑病相关 LCE3C(612615)_LCE3B(612614) 缺失中的一个(参见 603935)。

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