NUDIX 水解酶 2; NUDT2
核苷二磷酸酯连接部分 X MOTIF 2
NUDIX 主题 2
AP4A 水解酶 1; APAH1
HGNC 批准的基因符号:NUDT2
细胞遗传学位置:9p13.3 基因组坐标(GRCh38):9:34,329,569-34,343,699(来自 NCBI)
▼ 说明
AP4A 水解酶是负责维持细胞内二核苷 AP4A(二腺苷 5-素,5-三素-P(1),P(4)-四磷酸)水平的酶。人 AP4A 水解酶是 MutT(600312) 基序或“nudix”的成员。核苷酸水解酶家族,其功能可能是清除细胞中有毒的核苷酸代谢物(McLennan 等人总结,1998)。
▼ 克隆与表达
索恩等人(1995)从人胎儿肝脏和脾脏标准化 cDNA 文库中分离出 AP4A 水解酶 cDNA。该基因被命名为 APAH1,编码含有 MutT 序列基序的 147 个氨基酸的多肽。
▼ 测绘
麦克伦南等人(1998) 使用荧光原位杂交将 APAH1 基因定位到人类染色体 9p13。他们进一步将该基因相对于该区域的其他基因和标记进行定位,并获得了顺序 tel--D9S165--D9S1878--CNTFR(118946)--IL11RA(600939)--APAH1--GALT(606999)--D9S163- -CHH(250250)--D9S50--cen。
麦克伦南等人(1998) 提出,根据 9p13 区域存在多个抑癌基因的证据,并且考虑到哺乳动物 AP3A 水解酶基因(FHIT; 601153) 是一种可能的抑癌基因,APAH1 可能是一种候选肿瘤还有抑制基因。
▼ 分子遗传学
Anazi 等人的 2 姐妹(10DG0264 和 10DG0265)由沙特近亲结婚生,患有智力发育障碍,但不伴有周围神经病变(IDDPN;619844)(2017) 鉴定了 NUDT2 基因中的纯合无义突变(R12X; 602852.0001)。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过位置图谱证实,与家族中的疾病分离。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。这些患者属于 337 名智力障碍患者(智商记录为 70 或更低)的队列中的一部分,他们接受了基因分析。
亚乌兹等人(2018) 在来自 3 个不相关的沙特阿拉伯近亲亲属的 5 名 IDDPN 患者中发现了 NUDT2 基因纯合 R12X 突变。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。单倍型分析表明存在创始人效应。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。没有提到周围神经病变。
Diaz 等人在来自 2 个不相关家庭的 3 名患有智力发育障碍并伴有周围神经病变的患者中(2020) 在 NUDT2 基因(602852.0002) 的最后一个外显子中发现了纯合移码突变。通过全基因组或全外显子组测序发现的突变在两个家族中都与疾病分离。未受影响的父母是该突变的杂合子。一个家庭是墨西哥血统,另一个家庭是卡真血统;没有证据表明创始人效应。该变体在 gnomAD 数据库中的出现频率较低(非芬兰欧洲人为 0.02%,拉丁裔为 0.0086%)。迪亚兹等人(2020) 指出,由于突变发生在最后一个外显子,它可能会逃避无义介导的 mRNA 衰变,并产生截短的蛋白质,可能对周围神经产生毒性细胞效应。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 不伴有周围神经病变的智力发育障碍
NUDT2、ARG12TER
Anazi 等人的 2 姐妹(10DG0264 和 10DG0265)由沙特近亲结婚生,患有智力发育障碍,但不伴有周围神经病变(IDDPN;619844)(2017) 在 NUDT2 基因中鉴定出纯合 c.34C-T 转换(c.34C-T, NM_001244390.1),导致 N 端区域中的 arg12 到 ter(R12X) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过位置图谱证实,与家族中的疾病分离。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。这些患者属于 337 名智力障碍患者(智商记录为 70 或更低)的队列中的一部分,他们接受了基因分析。尽管没有提及周围神经病变,但患者存在肌张力低下、频繁跌倒和构音障碍。
在来自 3 个不相关的沙特阿拉伯近亲家庭的 5 名患有 IDDPN 的患者中,Yavuz 等人(2018) 鉴定了 NUDT2 基因中的纯合 c.34C-T 转变。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。单倍型分析表明存在创始人效应。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究,但预计会导致功能丧失。患者生长不良、肌张力低下、整体发育迟缓;没有提到周围神经病变。
.0002 伴有周围神经病变的智力发育障碍
NUDT2,1-BP DEL,186A
Diaz 等人在来自 2 个不相关家庭的 3 名患有智力发育障碍并周围神经病变(IDDPN; 619844) 的患者中(2020) 在 NUDT2 基因的最后一个外显子中发现了一个纯合 1-bp 缺失(c.186delA),预计会导致移码和提前终止(Ala63GlnfsTer3)。通过全基因组或全外显子组测序发现的突变在两个家族中都与疾病分离。未受影响的父母是该突变的杂合子。一个家庭是墨西哥血统,另一个家庭是卡真血统;没有证据表明创始人效应。该变体在 gnomAD 数据库中的出现频率较低(非芬兰欧洲人为 0.02%,拉丁裔为 0.0086%)。迪亚兹等人(2020) 指出,由于突变发生在最后一个外显子,它可能会逃避无义介导的 mRNA 衰变,并产生截短的蛋白质,可能对周围神经产生毒性细胞效应。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。除了智力障碍外,患者还有进行性感觉神经性周围神经病的电生理学证据。