小核仁 RNA,C/D 框,83A; SNORD83A

RNA,U83A 小核仁; RNU83A
snoRNA,U83A

HGNC 批准的基因符号:SNORD83A

细胞遗传学位置:22q13.1 基因组坐标(GRCh38):22:39,315,213-39,315,307(来自 NCBI)

▼ 说明

核糖体蛋白基因的内含子区域可以含有非编码小核仁 RNA(snoRNA),如 SNORD83A,它们是在前 mRNA 加工过程中产生的。 snoRNA 是参与前 rRNA 加工和修饰的小核仁核糖核蛋白颗粒(snoRNP) 的一部分。 C/D 类框的 snoRNA,如 SNORD83A,在 rRNA 的 2-prime-O-核糖甲基化中发挥作用(Duga et al., 2000)。

▼ 克隆与表达

杜加等人(2000) 在牛和人 RPL3(604163) 基因的内含子内鉴定了几种 snoRNA,包括 SNORD83A,他们将其称为 U83A。 U83A源自RPL3的内含子5。 95 个核苷酸的 U83A 具有与 18S RNA 互补的区域,并包含 box C/D snoRNA 的规范基序。序列分析表明U83A通过5-prime和3-prime末端序列的碱基配对形成茎环结构。在此模型中,环在茎的两侧包含框 C 和 D,其序列与紧邻框 D 上游的 18S rRNA 互补。使用牛探针的 Northern 印迹分析检测到 HeLa 细胞、小鼠成纤维细胞、和牛脑。 RT-PCR 检测牛肾细胞系中 U83A 的表达。

▼ 测绘

杜加等人(2000) 在染色体 22q 上的 RPL3 基因的内含子 5 中鉴定出 SNORD83A。

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