帕金森病 16; PARK16

细胞遗传学位置:1q32 基因组坐标(GRCh38):1:198,700,001-214,400,000

有关帕金森病的表型描述和遗传异质性的讨论,请参阅 PD(168600)。

▼ 测绘

佐竹等人(2009) 在日本人群中进行了一项大型全基因组关联研究,涉及 1,078 名帕金森病患者和 2,628 名对照者的发现队列,随后在 612 名病例和 14,139 名对照者中进行复制,并在 321 名病例和 1,614 名对照者中进行第二次复制。他们鉴定了 2 个对 1q32 染色体具有全基因组显着性的新易感性位点,命名为 PARK16 和 4p15。在染色体 1q32 上,rs947211 显示与 PD 的关联性最强(p = 1.52 x 10(-12),比值比(OR) = 1.30)。该 SNP 位于 RAB7L1(603949) 上游 8.5 kb 和 SLC41A1(610801) 下游 5.6 kb 处。发现与 PD 显着相关的 SNP 位于包含 5 个基因的多个连锁不平衡块内:SLC45A3(605097)、NUCKS1(611912)、RAB7L1、SLC41A1 和 PM20D1(617124)。 NUCKS1、RAB7L1 和 SLC41A1 包含在同一连锁不平衡块中。结果表明PARK16位点具有多个孤立的关联信号。佐竹等人(2009) 还发现与 4q22 上的 SNCA 基因(163890)(p = 7.35 x 10(-17)) 和 12q12 上的 LRRK2 基因(609007)(p = 2.72 x 10(-8)) 密切相关,两者均与帕金森病的常染色体显性遗传形式有关(分别为 PARK1、168601 和 PARK8、607060)。

西蒙-桑切斯等人(2009) 对 1,713 名欧洲血统 PD 患者和 3,978 名对照者进行了全基因组关联研究,随后在 3,361 名病例和 4,573 名对照者中进行了复制。与 Satake 等人合作(2009),西蒙-桑切斯等人(2009) 复制了 PARK16 基因座的作用(rs823128,OR = 0.66,p = 7.29 x 10(-8)),并发现支持证据表明 LRRK2 周围的常见变异可调节 PD 风险(rs1491923,OR = 1.14,p = 1.55×10(-5))。然而,在欧洲人群中并未发现与 4p15 上的假定基因座的关联。总体而言,这两项研究的数据显示了常见遗传变异在典型帕金森病病因学中的作用,并表明该疾病存在人群特异性遗传异质性。西蒙-桑切斯等人(2009) 还鉴定了 SNCA 基因(rs2736990, OR = 1.23, p = 2.24 x 10(-16)) 和 17q21 上的 MAPT 基因(157140) 中的关联信号(rs393152, OR = 0.77, p = 1.95 x 10( -16))。

谭等人(2010)专门分析了 433 名 PD 患者和 916 名对照者中 PARK16 位点的 5 个 SNP,这些患者都是中国人。发现 3 个 SNPS 具有显着的疾病关联:rs11240572、rs823128 和 rs823156,其中 rs823156 的关联最显着(校正 p = 0.0161;OR,0.77)。然而,rs16856139和rs947211未能达到显着性。

维拉里诺-奎尔等人(2010) 在 315 名台湾患者和 247 名台湾对照者的队列中复制了帕金森病和 rs823128 之间的关联(p = 0.015)。然而,在欧洲血统或突尼斯患者中,与该 SNP 的相关性并不显着。

马塔等人(2011) 在对来自西班牙北部的 1,445 名 PD 患者和 1,161 名对照进行的病例对照研究中,未能发现染色体 1q32 上 rs823156 或 rs947211 之间的关联。

▼ 分子遗传学

关联待确认

有关早发性帕金森病与认知功能障碍和染色体 1q32 上 ADORA1 基因变异之间可能关联的讨论,请参阅 102775.0001。

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