四三肽重复结构域蛋白 39B; TTC39B
HGNC 批准的基因符号:TTC39B
细胞遗传学位置:9p22.3 基因组坐标(GRCh38):9:15,163,622-15,307,216(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
谢等人(2016) 指出 TTC39B(他们称之为 T39)包含 3 个连续的四肽重复基序。在小鼠中,T39 mRNA 在肺和脾中表达最高,在肝脏和小肠中表达较低,在心脏、大脑、肾脏、脂肪和肾上腺中表达较低。小鼠肌肉中未检测到T39表达。
▼ 测绘
Hartz(2010) 根据 TTC39B 序列(GenBank AK091187) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 TTC39B 基因对应到染色体 9p22.3。
▼ 基因功能
特斯洛维奇等人(2010) 发现通过病毒载体敲低直系同源物 Ttc39b 的小鼠肝脏会导致血浆高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C) 水平显着升高。
▼ 分子遗传学
特斯洛维奇等人(2010) 对超过 100,000 名欧洲血统个体的血浆脂质进行了全基因组关联研究,并报告了 95 个显着相关基因座(P = 小于 5 x 10(-8)),其中 59 个显示出与血统的脂质性状在全基因组范围内显着关联。第一次。这 95 个基因座不仅导致脂质性状的正常变异,而且还导致极端脂质表型并影响 3 个非欧洲人群(东亚人、南亚人和非裔美国人)的脂质性状。特斯洛维奇等人(2010) 鉴定出 rs581080(染色体 9p22 上 TTC39B 基因中的一个 SNP)对 HDL-C 浓度有影响,效应大小为 -0.65 毫克/分升,P 值为 3 x 10(-12)。在肝脏中,与表达减少相关的等位基因与 HDL-C 增加相关。
▼ 动物模型
谢等人(2016) 发现 T39 敲除可以保护小鼠免受饮食引起的动脉粥样硬化和脂肪性肝炎的影响。与野生型相比,接受高脂肪/高胆固醇/胆盐饮食的 T39 -/- 小鼠 HDL 胆固醇和 Apoa1(107680) 增加,极低密度脂蛋白/乳糜微粒胆固醇减少,死亡率降低。食物喂养的 T39 -/- 小鼠的小肠肠细胞显示 Lxr-α(NR1H3; 602423) mRNA 和两种 Lxr-α 蛋白异构体的表达增加,以及 Lxr 靶标 Abca1(600046) 的表达增加。 T39 缺陷会减少肝脏甾醇调节元件结合蛋白 1(SREBP1 或 SREBF1;184756)的加工,并增加甾醇输出蛋白 Abcg5(605459) 和 Abcg8(605460) 的肝脏表达。 Lxr-α 的稳定增加了含有多不饱和脂肪酸的微粒体磷脂,并增加了介导磷脂酰胆碱生物合成的酶的表达。谢等人(2016) 得出的结论是,小鼠中的 T39 敲除保留了 Lxr 蛋白并激活了有益的基因表达谱,从而促进胆固醇去除并抑制脂肪生成。