干扰素相关发育调节因子2; IFRD2
干扰素相关蛋白
HGNC 批准的基因符号:IFRD2
细胞遗传学位置:3p21.31 基因组坐标(GRCh38):3:50,287,732-50,292,429(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Latif 等人在分析 3p21.3 的一个区域时发现,该区域在几种小细胞肺癌(SCLC) 细胞系中经历了重叠的纯合缺失(1997) 鉴定了代表一种新基因的 cDNA,他们将其命名为 SKMc15。 63 个 SCLC 细胞系中有 3 个细胞系纯合缺失 SKMc15。 Northern 印迹分析显示,SKMc15 在所有分析的胎儿和成人组织以及大多数肺肿瘤细胞系中以 1.8 至 2.0 kb mRNA 的形式表达。拉蒂夫等人(1997) 报道 442 个氨基酸的 SKMc15 蛋白的序列与假定的小鼠干扰素 β-2(147620) 蛋白的部分序列有 83% 的相似度。 SKMc15 蛋白还显示出与大鼠早期反应基因 PC4 及其鼠同源基因 TIS7 75% 的相似性。
Lerman 和 Minna(2000) 指出 IFRD2 是一种可溶性核蛋白,与小鼠蛋白有 93% 的一致性。它包含预测的二分核定位信号和犰狳-β 连环蛋白(CTNNB1; 116806) 样重复序列。在任何测试的肺癌细胞系中均未检测到突变。 Lerman 和 Minna(2000) 得出结论,鉴于缺乏检测到的突变及其表达模式,HYAL3 不太可能是候选肿瘤抑制基因。
▼ 基因结构
拉蒂夫等人(1997) 确定 SKMc15 基因包含 11 个外显子,跨度为 7 至 10 kb。通过基因组序列分析,Lerman 和 Minna(2000) 确定 IRFD2 基因包含 12 个外显子,跨度为 6 kb。
▼ 测绘
拉蒂夫等人(1997) 将 SKMc15 基因定位到染色体 3p21.3。