进行性视杆锥变性; PRCD
PRCD,狗,同源物
HGNC 批准的基因符号:PRCD
细胞遗传学位置:17q25.1 基因组坐标(GRCh38):17:76,527,586-76,553,580(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
进行性视杆锥变性(PRCD)是狗的一种晚发性常染色体隐性感光细胞变性,由 Prcd 基因突变引起。 Zangerl 等人通过在 EST 数据库中搜索与犬 Prcd 相似的序列,然后对视网膜 cDNA 文库进行 PCR(2006) 克隆人 PRCD。推导的 54 个氨基酸肽具有 N 端信号肽和 C 端跨膜结构域。 PRCD 的前 28 个氨基酸在人和狗之间完全保守。表位标记的 PRCD 在转染的 COS 细胞的整个细胞质中表达,其中细胞核周围的标记最多。
▼ 基因结构
赞格尔等人(2006) 确定 PRCD 基因包含 4 个外显子,最后一个是非编码的。在启动子区域内,PRCD 具有几个假定的 TATA 框和 CAAT 基序,以及 36 种不同转录因子的结合位点。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Zangerl 等人(2006) 将 PRCD 基因对应到染色体 17q22。
▼ 分子遗传学
赞格尔等人(2006) 分析了 1,836 名患有色素性视网膜炎和其他遗传性视网膜疾病的患者的 PRCD 基因。在一名患有常染色体隐性遗传色素性视网膜炎(RP36; 610599) 的孟加拉国 32 岁女性中,他们鉴定出 PRCD 基因(C2Y; 610598.0001) 中的错义突变纯合性,该突变与在患有 PRCD 的狗中观察到的突变相同。与野生型 PRCD 不同,突变蛋白在转染的 COS 细胞的细胞质内形成球形聚集体。
Nevet 等人在来自 9 个 RP 家庭的 18 名患者中,全部来自同一穆斯林阿拉伯村庄,近亲繁殖程度很高(2010) 鉴定出 PRCD 基因中无义突变的纯合性(R22X; 610598.0002)。该突变在该村的携带频率为 10%。
▼ 动物模型
Prcd 是导致犬失明的最广泛的遗传性视网膜疾病,其表型与人类色素性视网膜炎(见 268000)的犬对应。阿克兰等人(1998) 用一组超过 100 个锚定位点和基于微卫星的标记对多个 prcd 信息谱系进行了分型。他们鉴定出位于 pcd 侧翼的连锁群,该连锁群将疾病基因定位在犬染色体 9 的着丝粒末端附近,该区域与人类染色体 17q 远端具有保守的同线性。
赞格尔等人(2006) 在 Prcd 基因中发现了一个纯合突变,该突变与所测试的 18 个不同犬种或品种中的 pcd 表型完全一致。该突变(核苷酸 5 处的 G 到 A 转变)导致 C2Y 取代。在已确认不分离 prcd 的狗或品种中未观察到致病等位基因。
▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):
.0001 色素性视网膜炎 36
PRCD、CYS2TYR
Zangerl 等人对一名患有常染色体隐性视网膜色素变性(RP36; 610599) 的 32 岁孟加拉国女性进行了研究(2006) 鉴定了 PRCD 基因外显子 1 中核苷酸 5 处 G 到 A 转变的纯合性,导致 cys2 到 tyr(C2Y) 取代。在患有视网膜变性的狗中发现了相同的突变。与野生型 PRCD 不同,突变蛋白在转染的 COS 细胞的细胞质内形成球形聚集体。
.0002 色素性视网膜炎 36
PRCD、ARG22TER
Nevet 等人在来自同一穆斯林阿拉伯村庄的 9 个近亲家庭的 18 名色素性视网膜炎患者(RP36; 610599) 中(2010) 鉴定了 PRCD 基因外显子 1 中 64C-T 转换的纯合性,导致 arg22 到 ter(R22X) 取代。该创始人突变在该村庄中以 10% 的携带频率存在,并且在 130 个不相关的以色列穆斯林阿拉伯对照中未检测到。