原钙粘蛋白-γ,亚科 C,成员 3; PCDHGC3
PCDH-γ-C3
PC43
原钙粘蛋白 2,以前; PCDH2,前
HGNC 批准的基因符号:PCDHGC3
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,475,966-141,512,975(来自 NCBI)
▼ 说明
钙粘蛋白是钙依赖性细胞间粘附分子,原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。 PCDHGC3 是染色体 5q31 上 PCDHG 基因簇(604968) 内 22 个串联排列的基因之一。 22 个 PCDHG 基因作为“变量”发挥作用。外显子分别剪接到下游恒定区以形成不同的 PCDHG 转录物。可变的 PCDHG 外显子编码原钙粘蛋白的胞外和跨膜结构域,共同区域编码胞内结构域(Wu et al., 2001)。有关 PCDHG 基因的更多信息,请参阅 604968。
▼ 克隆与表达
萨诺等人(1993) 从几种生物体中分离出了编码 PCDHGC3 的 cDNA,他们将其命名为 pc43 和其他原钙粘蛋白。与 pc42(603626) 一样,人 pc43 包含 N 端胞外结构域、跨膜结构域和 C 端胞质区域。在人神经母细胞瘤细胞系提取物的蛋白质印迹中,pc43 以 150 kD 迁移。免疫荧光显微镜将 pc43 定位于细胞周围,主要是在细胞与细胞的接触位点。表达pc43的细胞表现出细胞聚集活性。
Wu 和 Maniatis(1999) 确定 Sano 等人克隆的 cDNA(1993) 包含 PCDHGC3 可变外显子及其下游内含子片段,但它缺少全长 PCDHGC3 中发现的 3 素恒定外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Wu 等人(2001) 将 PCDHGC3 基因对应到染色体 5q31,位于 PCDHGA12(603059) 下游约 43 kb 处,与 PCDHGC4(606305) 相邻。西米等人。 Wu et al.(1995) 指出,小鼠 Pcdh1、Pcdh2 和 Pcdh3(600931) 基因在染色体 18 上形成一个簇(2001) 将小鼠 PCDHG 基因定位到染色体 18c。