溶质载体家族25(线粒体载体、磷酸盐载体),成员25; SLC25A25
短钙结合线粒体载体2;SCAMC2
线粒体钙依赖性溶质载体;MCSC
KIAA1896
HGNC 批准的基因符号:SLC25A25
细胞遗传学位置:9q34.11 基因组坐标(GRCh38):9:128,068,232-128,109,245(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的胎儿脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(2001)克隆了SLC25A25,他们将其命名为KIAA1896。推导的 568 个氨基酸蛋白在 411 个氨基酸中与 SLC25A24(608744) 具有 65% 的同一性。RT-PCR ELISA检测到胎儿肝脏中表达最高,其次是成人肝脏、骨骼肌、卵巢、海马和尾状核。检查的所有其他组织和特定脑区域均显示出中等水平的 SLC25A25 表达。
Mashima 等人通过差异显示暴露于地塞米松的大鼠胰腺细胞系(2003) 克隆了大鼠 Slc25a25,他们将其命名为 Mcsc。大鼠和人类 SLC25A25 具有 97% 的同一性。对几种人体组织的 Northern 印迹分析检测到肝脏和骨骼肌中表达最强。SLC25A25也在所检查的人类消化道的所有部分中表达。人肝癌细胞系的免疫荧光显微镜检测到内源性 MCSC 呈点状和丝状模式,与线粒体染色重叠。
通过使用兔过氧化物酶体载体 Efinal 作为查询搜索 EST 数据库,然后对 HEK293 细胞总 RNA 进行 RT-PCR,del Arco 和 Satrustegui(2004) 克隆了 SLC25A25,他们将其命名为 SCAMC2。他们克隆了几个 SCAMC2 5-prime 变体,这些变体编码具有不同 N 末端的蛋白质。最突出的变体 SCAMC2a 包含 469 个氨基酸。它具有一个 N 端钙结合结构域,随后是 6 个跨膜区和一个短 C 端。钙结合结构域与钙调蛋白有 25% 的同一性(参见 114180)。SCAMC2 亚型与 SCAMC1(SLC25A24) 和 SCAMC3(SLC25A23; 608746) 具有显着相似性,但最大差异在于 N 末端。SCAMC2a 和 SCAMC2c 缺乏在其他 SCAMC 蛋白和钙调蛋白的钙结合域中发现的 4 个保守 EF-hand 基序中的第一个。SCAMC2d 缺少前 3 个 EF-hand 图案,而 SCAMC2b 包含所有 4 个 EF-hand 图案。Northern 印迹分析检测到 3.4 kb SCAMC2 转录物,该转录物在骨骼肌中显着表达,而在所有其他检查组织中丰度较低。与 SCAMC2c 相对应的 3.6-kb 转录本似乎仅限于大脑。PCR 分析在所有检查的组织中检测到 SCAMC2a,而 SCAMC2b 仅限于肾脏和肺。
▼ 基因结构
Del Arco 和 Satrustegui(2004) 确定 SLC25A25 基因包含 10 个外显子,长度约为 10 kb。老鼠 Slc25a25 基因具有相同的基因组结构。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,del Arco 和 Satrustegui(2004) 将 SLC25A25 基因定位到染色体 9q34.13。他们将小鼠 Slc25a25 基因定位到染色体 3G1 的一个区域,该区域显示出与人类染色体 9q34.13 的同线性同源性。