THO 复合体, 子单元 3; THOC3

TEX1,酵母,同源物;TEX1

HGNC 批准的基因符号:THOC3

细胞遗传学位置:5q35.2 基因组坐标(GRCh38):5:175,959,531-175,968,315(来自 NCBI)

▼ 说明

在酵母中,TREX(转录/输出)复合体包含 THO 转录延伸复合体,其在将 mRNA 输出蛋白共转录募集到新生转录本中发挥作用。人类 TREX 复合体包含 ALY(THOC4; 604171)、UAP56(DDX39B; 142560)、THOC3 和 THO 复合体的人类对应物(参见 THOC1; 606930)。人类 TREX 复合物似乎在剪接反应后期被招募到剪接的 mRNA,而不是像酵母那样通过直接共转录招募(Masuda 等人,2005)。

▼ 克隆与表达

Strasser 等人通过 SDS-PAGE 对核提取物中的 45 kD 蛋白质进行了分析,该蛋白质在 Pull-down 测定中与 UAP56 相互作用,然后进行数据库搜索(2002)获得了编码TEX1的全长cDNA。预测的蛋白质含有 351 个氨基酸,从酵母到人类都是保守的。

▼ 基因功能

Strasser 等人领导了酵母的功能研究(2002) 得出结论,TREX 复合物被特异性地招募到转录基因,并在转录延伸过程中与聚合酶一起移动。他们认为它在物理上连接了在 mRNA 输出或转录中起作用的蛋白质。

Masuda 等人使用 HeLa 细胞核提取物的免疫沉淀和质谱分析(2005) 发现人类 TREX 复合物含有 THO2(THOC2; 300395)、FSAP79(THOC5; 612733)、HPR1(THOC1)、UAP56、TEX1、FSAP35(THOC6; 615403)、ALY 和 FSAP24(THOC7; 611965)。免疫耗竭和凝胶过滤分析表明,THO2、HPR1、FSAP79、FSAP35 和 FSAP24 在 THO 复合物中紧密关联,而 UAP56、ALY 和 TEX1 关联较松散。任何 TREX 组分的免疫沉淀可有效免疫沉淀剪接的 mRNA 和 cDNA 转录本,但不能免疫沉淀未剪接的前 mRNA。任何成分的免疫耗竭对剪接体组装、剪接或 RNA 稳定性没有影响。TREX 复合物在检查的每个 mRNA 上组装。突变分析表明,ALY 的 C 末端是 UAP56 和 THO 复合物结合所必需的。UAP56 的 C 末端足以结合 ALY。UAP56 的 N 末端与 THO 复合物和 TEX1 的相互作用较弱,表明需要 UAP56 的其他区域才能实现最大结合。增田等人(2005) 的结论是,人类 TREX 复合物的募集并不像酵母那样直接与转录相关。

▼ 测绘

Hartz(2011) 根据 THOC3 序列(GenBank BC066325) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 THOC3 基因对应到染色体 5q35.2。

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