整联蛋白, α-11; ITGA11
HGNC 批准的基因符号:ITGA11
细胞遗传学定位:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:68,296,532-68,432,163(来自 NCBI)
▼ 说明
整联蛋白是由非共价连接的 α 链和 β 链组成的异二聚体,将细胞与细胞外基质或其他细胞连接起来。除了充当细胞骨架和细胞外配体之间的机械连接之外,整联蛋白还是信号转导受体,影响细胞增殖、细胞迁移和细胞分化等过程(Velling 等人总结,1999)。
▼ 克隆与表达
Velling 等人通过使用从胎儿成肌细胞 cDNA 文库中分离出的类整联蛋白 cDNA 片段来筛选子宫 cDNA 文库(1999)获得了编码整联蛋白α-11的全长cDNA序列。ITGA11 编码推导的 1,188 个氨基酸的蛋白质,包括 22 个氨基酸的信号肽。成熟的 1,166 个氨基酸蛋白质包含 23 个氨基酸跨膜区和 24 个氨基酸胞质尾。它与大多数其他整联蛋白α链的不同之处在于胞质尾部包含序列GFFRS而不是保守的GFFKR序列。胞外结构域包含 7 个 FG-GAP 重复序列,重复序列 2 和 3 之间有一个 195 个氨基酸的 I 结构域,其中包含保守的金属离子依赖性粘附位点基序。20 个半胱氨酸位于胞外域,并且有 16 个潜在的 N-糖基化位点。ITGA11 与 I 结构域 α-整联蛋白 ITGA10(604042)、ITGA1(192968) 和 ITGA2(192974) 的同一性分别为 42%、37% 和 35%。Northern 印迹分析显示大约 5.5 kb ITGA11 转录物的表达。在子宫中表达最高,在心脏中表达最强,在骨骼肌、胃、小肠、膀胱、前列腺和结肠中表达中等,在非肌肉组织如胰腺、肾和胎盘中表达较低。相比之下,作者发现 ITGA1 在子宫中不表达。免疫沉淀研究和 SDS-PAGE 分析表明,ITGA11 编码 145 kD 的蛋白质,大小介于 ITGA2 或 ITGA10 和 ITGA1 之间;作者认为这种差异可能是由于糖基化差异造成的。与其他含有 I 结构域的整联蛋白一样,ITGA11 与胶原蛋白结合。
通过序列分析,Lehnert 等人(1999) 发现推导的 ITGA11 蛋白含有 207 个氨基酸的 I 结构域和 1,167 个氨基酸的成熟蛋白中的 15 个 N-糖基化位点。
▼ 测绘
作者:FISH,Velling 等人(1999) 将 ITGA11 基因对应到染色体 15q23。通过体细胞杂交分析和 FISH,Lehnert 等人(1999)将该基因定位到15q22.3-q23。