SMG7 无义介导的 mRNA 衰减因子; SMG7

SMG7, 线虫, 同源物
更短端粒 1 的同源物, 酿酒酵母, 同源物, C; EST1C
KIAA0250

HGNC 批准的基因符号：SMG7

细胞遗传学位置：1q25.3 基因组坐标（GRCh38）：1:183,472,499-183,554,191（来自 NCBI）

▼ 说明

SMG7 参与无义介导的 mRNA 衰减（Fukuhara 等，2005）。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从尺寸分级的未成熟骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序（1996） 克隆了 SMG7，他们将其命名为 KIAA0250。推导的蛋白质包含 ATP/GTP 结合位点基序 A 和推定的跨膜结构域。Northern 印迹分析检测到所有检查的组织和细胞系中都有中等程度的 SMG7 表达。

苏德等人（2001） 在染色体 1 的遗传性前列腺癌 1（HPC1; 176807） 区域中鉴定出了 SMG7。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 6 kb SMG7 转录物。

Snow 等人通过在数据库中搜索与酿酒酵母 Est1 相似的序列（2003） 鉴定了 SMG7，他们将其称为 EST1C。推导的 1,122 个氨基酸蛋白具有 N 端 Est1 同源结构域，其中包含 2 个四肽重复（TPR） 基序。

Ohnishi 等人通过在 EST 数据库中搜索线虫 Smg7 的直系同源物（2003） 鉴定了 2 个选择性剪​​接的 SMG7 变体：SMG7S 和 SMG7L，它们分别编码 1,091 个和 1,137 个氨基酸的蛋白质。两种 SMG7 亚型都具有线虫蛋白中未发现的亮氨酸拉链。Western blot 分析检测到 135 和 140 kD 的内源 SMG7 蛋白。细胞分级分离实验表明，两种 SMG7 亚型主要存在于胞质中，但在用核输出抑制剂处理后，它们在细胞核中积累。

▼ 生化特征

福原等人（2005） 以 2.55 埃分辨率确定了人 SMG7 N 端 652 个氨基酸的晶体结构。他们发现这个包含 TPR 基序的区域形成 α-螺旋发夹，并与人类 14-3-3-zeta（YWHAZ; 601288） 具有结构相似性，包括一个保守的磷酸丝氨酸结合位点。SMG7 的 14-3-3-zeta 样结构域在 SMG5（610962） 和 SMG6（610963） 中是保守的。

▼ 基因功能

Ohnishi 等人使用免疫沉淀和免疫耗竭实验（2003） 表明 SMG5 和 SMG7 与 UPF1 的过度磷酸化形式（RENT1; 601430） 相关，并且 SMG5 参与 UPF1 去磷酸化。SMG5 与纯化的蛋白磷酸酶 2A（PP2A） 复合物相互作用，并与 PP2A 催化子单元 PP2AC 共免疫沉淀（参见 PPP2CA；176915）。表位标记的 SMG5 和内源 SMG7 的免疫沉淀物均含有内源 PP2AC。大西等人（2003） 得出结论，SMG7 参与无义介导的 mRNA 衰减途径。

Fukuhara 等人使用下拉分析（2005）表明重组SMG7的14-3-3-zeta样结构域结合磷酸化的UPF1。SMG7 磷酸丝氨酸结合位点的突变损害了 SMG7-UPF7 结合以及 UPF1 向转染 HeLa 细胞中细胞质 mRNA 衰变灶（P 小体）的募集。

阿扎林等人（2007） 证明哺乳动物端粒被转录成含有端粒重复的 RNA（TERRA）。TERRA 分子长度不同，从几个亚端粒位点向染色体末端转录，并定位于端粒。阿扎林等人（2007） 还表明，生殖器形态发生缺陷的抑制蛋白（SMG） 是无义介导的 mRNA 衰变的效应子，在体内富集于端粒，负向调节 TERRA 与染色质的关联，并保护染色体末端免受端粒损失。因此，阿扎林等人（2007） 得出结论，端粒主动转录成 TERRA，SMG 因子代表 TERRA 调节和端粒完整性维持之间的分子联系。

▼ 基因结构

苏德等人（2001）确定SMG7基因含有17个外显子。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析，Nagase 等人。Sood 等（1996） 将 SMG7 基因对应到染色体 1（2001） 通过基因组序列分析将 SMG7 基因定位到染色体 1q25。