五聚环蛋白 4; PTX4

五聚环蛋白 4, LONG

HGNC 批准的基因符号:PTX4

细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:1,485,886-1,488,944(来自 NCBI)

▼ 说明

PTX4属于多功能保守蛋白五聚环蛋白(PTX)超家族。五聚环蛋白的特征在于环状多聚体结构和约200个氨基酸的保守C端五聚环蛋白结构域。所有五聚环蛋白都具有保守的 8 个氨基酸序列 HxCxS/TWxS,其中 x 是其五聚环蛋白结构域内的任何氨基酸。五聚环蛋白分为短蛋白,如C反应蛋白(CRP;123260)和血清淀粉样蛋白P蛋白(APCS;104770),和长蛋白,如PTX3(602492)和PTX4。一些 PTX 是先天免疫体液臂的一部分,通过介导凝集、补体激活和调理作用而充当抗体的功能祖先(Martinez de la Torre 等人总结,2010)。

▼ 克隆与表达

Martinez de la Torre 等人利用豚鼠 apxin 的序列在数据库中搜索新型五聚环蛋白,然后对小鼠胸腺和人小肠 cDNA 文库进行 RT-PCR(2010)克隆了小鼠和人类PTX4。推导的小鼠蛋白质和人类蛋白质均含有478个氨基酸,并且它们有64%的同一性。它们都具有假定的信号肽、N-糖基化位点和 C 端五聚环蛋白结构域。RT-PCR分析显示PTX4在人体组织中广泛表达,在小肠、睾丸和骨髓中表达水平最高,在大脑和其他检查组织中表达较低。在脾和胸腺中,基质中的表达高于造血细胞中的表达。

▼ 基因结构

马丁内斯·德拉·托雷等人(2010)确定PTX4基因含有3个外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析,Martinez de la Torre 等人(2010) 将 PTX4 基因定位到染色体 16p13.3。他们将小鼠基因定位到染色体17A3.3

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