高迁移率基团核小体结合蛋白 3；HMGN3

甲状腺激素受体相互作用子 7；TRIP7

HGNC 批准的基因符号：HMGN3

细胞遗传学定位：6q14.1 基因组坐标（GRCh38）：6:79,201,245-79,234,682（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

甲状腺激素受体（TR）是激素依赖性转录因子，调节多种特定靶基因的表达。当它们从最初的转录和核易位发展到与类维生素A X 受体（RXR）的异二聚化、与其他转录因子和基本转录装置的功能相互作用以及最终降解时，它们必须与许多蛋白质发生特异性相互作用。为了帮助阐明转录效应和 TR 的其他潜在功能背后的机制，Lee 等人（1995）使用酵母相互作用陷阱（酵母 2-杂交系统的一个版本）来识别与配体特异性相互作用的蛋白质 -大鼠TR-β结合域（THRB; 190160）。他们分离出了编码几种不同TR相互作用蛋白（TRIPs）的HeLa细胞cDNA，其中包括TRIP7。TRIP7与非组蛋白染色质小蛋白HMG14（HMGN1；HMGN1）密切相关。163920）和HMG17（HMGN2；163910），它直接与核心核小体结合，并被认为与活性染色质特异性相关。Northern 印迹分析在多个组织中检测到 1.1 kb TRIP7 转录物，其中在心脏和肾脏中表达最高。

通过分析 EST 数据库，West 等人（2001）鉴定了 HMGN3 的截短形式，该形式是由引入移码的 41 个核苷酸缺失引起的。他们将全长蛋白 HMGN3a 和截短蛋白 HMGN3b 命名。HMGN3a 包含一个 N 端核定位信号（NLS），随后是一个核苷酸结合结构域、第二个 NLS 和一个 C 端染色质解折叠和转录激活结构域（CHUD）。HMGN3a 与 HMGN1 和 HMGN2 分别具有 41% 和 54% 的氨基酸同一性，其中 C 末端差异最大。77 个氨基酸的 HMGN3b 蛋白与 HMGN3a 直到 gly72 相同，并且缺少大部分 C 端 CHUD 结构域。Northern 印迹分析在所有检查的组织中检测到 0.9、1.5 和 2.7 kb 的转录物；最小的转录本最丰富。RNA点印迹分析在几乎所有测试的组织中均检测到HMGN3，其中胰腺中的水平最高，大脑中的水平最低。Western blot分析检测HeLa细胞中表达的内源性HMGN3a和HMGN3b。West et al.（2001）也在小鼠、大鼠、牛和青蛙中鉴定出同源的Hmgn3a和Hmgn3b序列。对小鼠组织的RNA点印迹分析显示，其表达模式与人体组织中观察到的模式显着不同，其中脑和前列腺中的水平最高，胰腺中的水平最低。

▼ 基因功能

Lee等（1995）发现TRIP7仅在甲状腺激素存在的情况下与大鼠Thrb相互作用。它还显示出与 RXR-α（RXRA；180245），但不与糖皮质激素受体（NR3C1；138040）在任何情况下。

West等人（2001）在凝胶阻滞测定中证明HMGN3a结合核小体。HMGN3a 没有可检测到的序列偏好。

West et al.（2004）通过微阵列分析发现，将小鼠Hmgn3a和Hmgn3b转染小鼠肝癌细胞系后，基因表达模式不同，但两种变体均上调Glyt1（SLC6A9；SLC6A9）的表达。601019）。Hmgn3 和 Glyt1 在视网膜中共表达，染色质免疫沉淀分析显示 Hmgn3 与 Glyt1 基因的包含 Glyt1a 转录起始位点的区域结合。West et al.（2004）得出结论，HMGN3调节GLYT1表达，并且HMGN家族成员可以调节特定基因的转录。

▼ 基因结构

West et al.（2001）确定HMGN3基因包含6个外显子，跨度超过32 kb。内含子 1 为 18 kb。CpG 岛跨越整个启动子区域，直至核苷酸 922，但它不如 HMGN1 和 HMGN2 的 CpG 岛突出。HMGN3具有CCAAT框和SRY（480000）结合位点。与HMGN1和HMGN2不同，它没有TATA框或Sp1（189906）共有位点。

▼ 测绘

West等（2001）通过基因组序列分析，将HMGN3基因定位到染色体6q27。他们鉴定出 2 个 HMGN3 逆转录假基因，均位于染色体 1q21.3。