岩藻糖基转移酶 10; FUT10

FUCTX

HGNC 批准的基因符号:FUT10

细胞遗传学定位:8p12 基因组坐标(GRCh38):8:33,308,061-33,473,146(来自 NCBI)

▼ 说明

FUT10(EC 2.4.1.65)属于岩藻糖基转移酶家族,可将岩藻糖从GDP-岩藻糖转移到N-乙酰基-D-葡萄糖胺(GalNAc)残基上,以1,3键连接到半乳糖(Gal)-1,4-GlcNAc上-R和/或以1,4键连接到Gal-1,3-GlcNAc-R上(Baboval和Smith,2002)。

▼ 克隆与表达

Roos et al.(2002)以果蝇岩藻糖基转移酶为查询,鉴定了人FUT10和FUT11的部分序列(616932)。

使用s Fuctiv(FUT4;)进行数据库分析 104230)作为查询,Baboval 和 Smith(2002)识别出了小鼠和人类 FUT10 和 FUT11,他们分别将其称为 FUCTX 和 FUXTXI。数据库分析表明存在 FUCTX 剪接变体。FUCTX 具有短的细胞质 N 末端尾部,后面是跨膜区和具有保守 FENA 基序的胞外糖基转移酶结构域。Northern印迹分析在所有检查的小鼠组织中检测到大约3.5-kb Fuctx转录物的可变表达,其中肝脏和胸腺中的水平最高。小脑原位杂交检测到浦肯野细胞以及内部颗粒细胞层中 Fuctx 的强表达。表位标记的人 FUCTX 在转染的 COS 细胞中以核周模式表达。

Mollicone等人(2009)通过对人类胚胎和成人大脑的总RNA进行RT-PCR,克隆了FUT10的3个剪接变体。数据库分析揭示了一个额外的剪接变体。这些变体的不同之处在于使用替代起始密码子和终止密码子,以及剪接位点选择和外显子跳跃。胚胎转录本编码 391 和 419 个氨基酸的推导蛋白质。较小的蛋白质缺乏 N 端跨膜结构域,可能是可溶的,而较大的蛋白质则具有预测的 N 端内质网(ER)保留信号。成体转录物编码推导的 479 个氨基酸的蛋白质,具有 N 端跨膜结构域和 N 端和 C 端的 ER 保留信号。计算机中鉴定的变体编码推导的 428 个氨基酸的可溶性亚型。所有 FUT10 蛋白都具有其他 α-1,3-岩藻糖基转移酶中发现的 5 个保守基序中的 4 个,但它们的不同之处在于涉及受体底物识别的第二个基序。所有亚型都至少有 3 个 N-糖基化位点。Northern blot 分析在 50 至 70 天的胚胎中检测到 4 个 FUT10 转录本,大小从 3 kb 到 12 kb,其中 3 kb 转录本的丰度最高。4种转录物的表达在成人和胎儿组织中具有组织特异性,并且成人和胎儿组织之间的表达模式不同。荧光标记的 FUT10 同工型具有 419 和 479 个氨基酸,定位有 ER 标记,而 391 个氨基酸同工型则定位有溶酶体标记,并且可能已被降解。

▼ 基因结构

Mollicone et al.(2009)确定FUT10基因全长102 kb,包含7个外显子。他们在外显子 4 的 3-prime 一侧的 17-GT 重复序列中鉴定出了一个微卫星序列。

▼ 测绘

Baboval and Smith(2002)指出FUT10基因定位于染色体8。Mollicone et al.(2009)确定FUT10基因定位于染色体8p11.23。

Gross(2016)根据FUT10序列(GenBank BC004884)与基因组序列(GRCh38)的比对,将FUT10基因定位到染色体8p12。

▼ 基因功能

Mollicone等人(2009)通过分析COS-7细胞中表达的含有479、419和391个氨基酸的人FUT10亚型,发现所有亚型都将岩藻糖从GDP-岩藻糖转移到生物素(一种天然双触角寡糖)上。使用一组双触角和 N-聚糖相关受体表明,与其他 α-1,3-岩藻糖基转移酶相比,FUT10 同种型在没有 MnCl2 的情况下发挥作用,并使用双触角 N-聚糖受体,包括最内部的 Glc-NAc 残基,而不是短线性受体。Mollicone等人(2009)得出结论,FUT10受体底物和活性特征与经典的单外显子α-1,3-岩藻糖基转移酶(例如FUT3(111100))不同。

▼ 进化

Mollicone等人(2009)鉴定了脊椎动物中的FUT10直系同源物、脊椎动物和尾索动物中的FUT11直系同源物以及昆虫和低等生物中的FUT10和FUT11相关酶。研究结果表明,FUT10和FUT11的祖先出现在约9.8亿年前(MYA),并且在约830 MYA发生了复制事件。

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