SPEEDY/RINGO 细胞周期调节剂家族,E4 成员;SPDYE4
SPEEDY B1
HGNC 批准的基因符号:SPDYE4
细胞遗传学定位:17p13.1 基因组坐标(GRCh38):17:8,747,532-8,758,546(来自 NCBI)
▼ 说明
细胞周期的顺利完成依赖于细胞周期蛋白依赖性激酶(CDKs;参见CDK1,116940)。SPDYE4属于细胞周期调节因子Speedy/RINGO家族,预计是CDK活性的正调节因子(Chauhan et al., 2012)。
▼ 克隆与表达
Chauhan等人(2012)报道SPDYE4,他们称之为Speedy B1,含有237个氨基酸,并且在C末端附近有一个大约140个残基的Speedy框。Speedy 框子有 2 个图案,在人类和鱼类之间几乎 100% 保守。对 12 种人体组织的 Northern 印迹分析检测到 Speedy B1 主要在睾丸中表达。缪拥有2个Speedy B1基因。RT-PCR 对 8 个睾丸组织检测到睾丸中几乎独有的 Speedy B1a 和 B1b 表达。
▼ 进化
SPDYE4,Chauhan et al.(2012)称为Speedy B或Speedy B1,属于Speedy基因的一个分支,经历了谱系特异性复制。灵长类谱系中的孤立复制产生了 Speedy B2(SPDYE3;617625)和Speedy B4(SPDYC;614030)。人类(而非黑猩猩)表现出进一步的重复,从而产生了 Speedy B2-like-1(SPDYE2;617624)、Speedy B2-like 2(SPDYE1;617623)。在灵长类动物中,Speedy B2 和 B2 样基因也表现出高拷贝数变异,这很可能是串联片段复制的结果。Speedy B 基因在啮齿动物谱系中孤立复制,在小鼠和大鼠中产生 Speedy B1a 和 Speedy B1b。大鼠和小鼠谱系中完全缺失 Speedy B4。低等脊椎动物,如象鲨、爪蟾和海鞘,只有一个 Speedy B 基因。
▼ 测绘
Hartz(2017)根据SPDYE4序列(GenBank BC146966)与基因组序列(GRCh38)的比对,将SPDYE4基因定位到染色体17p13.1。
老鼠 Spdye4 基因定位到染色体 5(Chauhan et al., 2012)。