UDP-N-乙酰-α-D-半乳糖胺：多肽N-乙酰半乳糖胺基转移酶12；GALNT12

GalNAc 转移酶 12；GalNAcT12

HGNC 批准的基因符号：GALNT12

细胞遗传学定位：9q22.33 基因组坐标（GRCh38）：9:98,807,670-98,850,081（来自 NCBI）

▼ 说明

GALNT12是UDP-GalNAc：多肽N-乙酰半乳糖胺基转移酶家族（EC 2.4.1.41）的成员，它催化N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）从UDP-GalNAc转移到多肽受体上的羟基氨基酸上。粘蛋白型O-连接蛋白糖基化步骤（Guo et al., 2002）。

▼ 克隆与表达

通过在EST和基因组DNA数据库中搜索与GALNT4（603565）相似的序列，然后对肺cDNA文库进行PCR，Guo等（2002）克隆了GALNT12。推导的 581 个氨基酸的蛋白质包含 N 端胞质结构域、跨膜结构域和推定的茎区。预测的 GALNT12 催化结构域包含其他 GalNAcT 家族成员共有的 GT1 基序、Gal/GalNAc 转移酶基序和蓖麻毒素样凝集素基序。GALNT12 与其他 GalNAcT 家族成员具有 32% 至 56% 的氨基酸序列同源性，与 GALNT4 的同源性最高。郭等人（2002）利用实时定量PCR检测到大多数组织中的表达，其中小肠、胃、胰腺和结肠中表达量最高，睾丸、甲状腺和脾中表达量中等。

▼ 基因结构

Guo等（2002）确定GALNT12基因含有10个外显子。

▼ 测绘

通过序列分析，Guo等（2002）将GALNT12基因定位到染色体9q22。

▼ 基因功能

利用昆虫细胞中表达的重组 GALNT12 蛋白，Guo 等（2002）对 GALNT12 酶活性进行了表征，并确定 GALNT12 将 GalNAc 转移至源自 Muc1（158340）、Muc5ac（158373）和 Muc10 的肽，但对Muc2（158370）和Muc7（158375）的肽。Guo等（2002）提出GALNT12可能在消化器官粘蛋白型寡糖生物合成的起始步骤中发挥作用。

▼ 分子遗传学

Guda et al.（2009）在 272 名不相关的结肠癌患者中的 6 名患者的种系中发现了 6 个不同的 GALNT12 基因杂合功能丧失突变（参见，例如 610290.0001-610290.0003）（CRCS1；608812）。在 192 个对照中未发现任何变异。这些突变都落在催化或凝集素结合域内，转染研究显示酶活性显着丧失。野生型 GALNT2 等位基因保留在 4 名种系突变患者的肿瘤 DNA 中，但在 1 名患者的肿瘤组织中显示杂合性丢失。此外，在 30 个微卫星稳定结肠肿瘤中的 2 个中发现了 2 种不同的体细胞 GALNT12 突变。Guda et al.（2009）推测结肠中表达的蛋白质糖基化异常降低可能在癌症发展中发挥作用。

▼ 等位基因变异体（3个精选例子）：

.0001 结直肠癌，易感性，1

GALNT12、MET1ILE

Guda等人（2009）在272名无关的结肠癌患者中的1名（608812）中发现了GALNT12基因中的杂合种系G到A转变，导致起始基因中met1到ile（M1I）的取代。密码子。转染研究表明该突变导致蛋白质表达缺失。该患者是一名非裔美国女性，患有晚发性近端结肠癌和右乳房原位导管癌。在 192 个对照中未发现该突变。

.0002 结直肠癌，易感性，1

GALNT12、THR491MET

Guda等人（2009）在272名无关的结肠癌患者中的1名（608812）中发现了GALNT12基因中的杂合种系突变，导致thr491-to-met（T491M）取代。转染研究表明，突变产生的蛋白质具有 2% 的残留蛋白质活性。该患者是一名白人男性，患有晚发性盲肠近端结肠癌和脾曲结肠癌。在 192 个对照中未发现该突变。

.0003 结直肠癌，易感性，1

GALNT12、TYR395TER

Guda等人（2009）在272名无关的结肠癌患者中的1名（608812）中发现了GALNT12基因中的杂合种系突变，导致tyr395-to-ter（Y395X）取代。转染研究表明，该突变导致不稳定的截短蛋白。患者是一名患有迟发性直肠癌的白人男性。在 192 个对照中未发现该突变。