硫辛酸合成酶;LIAS

HGNC 批准基因符号:LIAS
细胞遗传学定位:4p14 基因组坐标(GRCh38):4:39,459,056-39,479,506(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过EST数据库搜索与酿酒酵母硫辛酸合酶同源的序列,Stanchi等人(2001)鉴定出了人类LIAS。推导的 113 个氨基酸蛋白质与酿酒酵母酶有 60% 的同一性。Morikawa等人(2001)根据拟南芥硫辛酸合酶序列设计了PCR引物,并使用所得产物从小鼠心脏cDNA文库中克隆了Lias。推导的 373 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 42 kD。N 端 26 个氨基酸编码潜在的线粒体靶向前序列,去除后将产生 347 个氨基酸的推导成熟蛋白,分子量约为 39 kD。Northern 印迹分析检测到 1.8 kb 信息的表达主要在心脏、睾丸和肝脏中。将荧光标记的 Lias 转染至 CHO 细胞中,揭示了与线粒体标记重叠的细胞内定位。

▼ 基因功能

Morikawa等人(2001)利用缺乏硫辛酸合酶的大肠杆菌细胞证实了小鼠Lias编码硫辛酸合酶。用携带小鼠Lias的质粒转化突变型大肠杆菌细胞,恢复了细胞在无硫辛酸培养基中生长的能力。N 端 26 个氨基酸缺失的 Lias 增强了突变体的生长至接近正常水平。

▼ 分子遗传学

通过自合性作图和候选基因分析,对一名患有高甘氨酸血症、乳酸性酸中毒和癫痫的男孩进行候选基因分析(HGCLAS;614462),又称丙酮酸脱氢酶硫辛酸合成酶缺乏症(PDHLD),Mayr等(2011)在LIAS基因中发现了一个纯合错义突变(R249H;607031.0001)。出生后第 3 天,患者出现癫痫发作、肌张力减退和吸吮不良。他的病情恶化,并出现反复发作的呼吸暂停和与血清乳酸升高相关的意识下降。出生第 11 天,他的代谢进一步恶化,出现急性呼吸衰竭,需要人工通气 17 天。尿液分析显示戊二酸和甘氨酸增加,血浆甘氨酸也增加。病情稳定后,孩子出现精神运动发育严重迟缓、痉挛性四肢瘫痪伴挛缩、癫痫、小头畸形以及血清乳酸间歇性升高。4岁时,他因呼吸道感染在家中去世。11 个月大时的肌肉活检显示线粒体丙酮酸氧化存在严重缺陷。免疫组织化学和免疫印迹研究显示丙酮酸脱氢酶(PDH)复合物的E2(608770)和E3(238331)结合蛋白、α-酮戊二酸(126063)的E2子单元和硫辛酸减少。患者体内甘氨酸的增加反映了硫辛酸代谢的缺陷,因为甘氨酸裂解也需要这种辅助因子。

Baker等人(2014)在2名无血缘关系的HGCLAS患儿中鉴定出LIAS基因中的2种不同的纯合错义突变(E159K, 607031.0002和D215E, 607031.0003)。这些突变是通过对参与硫辛酸代谢的候选基因进行测序发现的,并与家族中的疾病分开。用野生型 LIAS 转染 1 名患者的成纤维细胞后,PDH 复合物的活性恢复正常。

Wongkittichote et al.(2023)在一名 HGCLAS 患者中发现了 LIAS 基因的复合杂合突变(D181V, 607031.0004 和 L93X, 607031.0005)。这些突变通过全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。酵母细胞中LIAS同源物(lip5)无效的生长缺陷可以被人类野生型LIAS修复,但不能被具有D181V突变的LIAS修复。

▼ 等位基因变异体(5个精选例子):

.0001 高甘氨酸血症、乳酸中毒和癫痫发作

利亚斯,ARG249HIS

患有高甘氨酸血症、乳酸性酸中毒和癫痫发作的患者(HGCLAS;614462),Mayr等人(2011)在LIAS基因的外显子8中鉴定出纯合的c.746G-A转换,导致高度保守的残基中arg249到his(R249H)的取代。大肠杆菌的体外功能表达研究表明,在缺乏硫辛酸的情况下生长时,该突变会导致生长缺陷,这与功能丧失一致。

.0002 高甘氨酸血症、乳酸中毒和癫痫发作

利亚斯,GLU159LYS

一名索马里近亲出生的女孩患有高血糖症、乳酸性酸中毒和癫痫发作(HGCLAS;Baker et al.(2014)在LIAS基因中发现了一个纯合的c.475_477GAG-AAA突变(见614462),导致高度保守的残基处由glu159替换为lys(E159K)。未受影响的父母是突变杂合子。患者细胞没有显示出可见的硫辛酸化 E2 蛋白,并且丙酮酸脱氢酶复合物的活性降低。未进行功能研究。

.0003 高甘氨酸血症、乳酸中毒和癫痫发作

利亚斯,ASP215GLU

一名男孩,父母无关,为土耳其人,患有高血糖症、乳酸性酸中毒和癫痫发作(HGCLAS;Baker et al.(2014)在LIAS基因中发现了纯合的c.645T-A颠换(C.614462),导致高度保守的残基处出现asp215-to-glu(D215E)取代。未受影响的父母是突变杂合子。患者细胞显示硫酰化 E2 蛋白水平降低,丙酮酸脱氢酶复合物活性降低,这可以通过野生型 LIAS 转染来恢复。

.0004 高甘氨酸血症、乳酸中毒和癫痫发作

利亚斯,ASP181VAL

患有高甘氨酸血症、乳酸性酸中毒和癫痫发作的患者(HGCLAS;614462),Wongkittichote et al.(2023)鉴定了LIAS基因中的复合杂合突变:c.542A-T转换(c.542A-T, NM_006859.4),导致asp181-to-val(D181V)替换高度保守的残基,以及1-bp的缺失(c.277delC; 607031.0005),导致Leu93_Lys94insTer突变。这些突变经全外显子组测序鉴定并经桑格测序证实,在父母体内以携带者状态存在。这两种突变均不存在于 gnomAD 数据库中(12/11/2022)。酵母细胞中LIAS同源物(lip5)无效的生长缺陷可以被人类野生型LIAS修复,但不能被具有D181V突变的LIAS修复。

.0005 高甘氨酸血症、乳酸中毒和癫痫发作

LIAS,1-BP DEL,277C

讨论LIAS基因中的1-bp缺失(c.277delC,NM_006859.4),导致Lys92_Leu93insTer突变,该突变在高甘氨酸血症、乳酸性酸中毒和癫痫患者的复合杂合状态下被鉴定(HGCLAS;614462),Wongkittichote 等人(2023),参见 607031.0004。

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