VPS54 GARP 复合体子单元;VPS54

液泡蛋白分选 54,酿酒酵母,同源物
VPS54-LIKE;VPS54L
WOBLER, 鼠标, 同源; WR
SLP8

HGNC 批准的基因符号:VPS54

细胞遗传学定位:2p15-p14 基因组坐标(GRCh38):2:63,892,150-64,019,428(来自 NCBI)

▼ 说明

VPS54 是内体来源的转运囊泡与跨高尔基体网络的束缚和融合所需的蛋白质复合物的组成部分(Perez-Victoria et al., 2010)。

▼ 克隆与表达

通过在数据库中搜索与大鼠蛋白相似的序列,Walter等人(2002)鉴定出了人类VPS54,他们将其称为VPS54L。推导的 966 个氨基酸蛋白质具有中央卷曲螺旋区域和几个双亮氨酸基序。

Liewen et al.(2005)克隆了人VPS53,并鉴定了编码缺乏氨基酸46至57的亚型的剪接变体。COS-7细胞的免疫荧光显微镜显示Vps52(603443)、Vps53(615850)和Vps54表达与高尔基体蛋白Gm130(GOLGA2; 602580)位于极化的核周区域,内体标记Mpr(参见IGF2R,147280)和Tfr(190010)位于核周包膜。犬细胞的亚细胞分离实验在平滑膜/高尔基体部分中检测到 3 种 VPS 蛋白,但在细胞质中未检测到。

Schmitt-John et al.(2005)鉴定了小鼠Vps54的剪接变体。主要异构体含有 977 个氨基酸。X-gal 报告基因的杂合表达揭示了成年动物中广泛存在的低水平 Vps54 表达。

▼ 基因功能

Liewen et al.(2005)通过免疫共沉淀分析发现,人VPS54与人VPS52和VPS53存在相互作用。RAB6B(615852)和STX10(603765)的短亚型可以免疫沉淀VPS52,但不能免疫沉淀VPS53或VPS54。

▼ 测绘

Walter et al.(2002)将大鼠和小鼠的Vps54基因分别定位到染色体14q22和11A3区域,与人类染色体2p14-p13具有同源性。

Gross(2012)根据VPS54序列(GenBank BC030275)与基因组序列(GRCh37)的比对,将VPS54基因定位到染色体2p14。

▼ 动物模型

Kaupmann et al.(1992)将“wobbler”基因座(wr)定位到近端小鼠染色体11。wobbler小鼠(基因型wr/wr)显示运动神经元疾病和性腺功能障碍。Kaupmann et al.(1992)指出,摆动小鼠不太可能是人类脊髓性肌萎缩症(SMA;SMA;参见 253300),因为它具有精子发生缺陷,而在已到青春期的男性 SMA 患者中尚未有报道。

Heimann et al.(1991)表明,摇摆小鼠的精子头部呈圆形,活力降低。在摇摆睾丸的组织学切片中,直到圆形精子细胞阶段,精子发生都显得正常,但在精子发生后期,细胞核没有发生伸长和变平。与对照组相比,摇摆睾丸中精子细胞核的数量减少了 70% 至 80%。虽然顶体标记糖蛋白Pum(MUC1; 158340)合成时,顶体膜不附着在细胞核上。Heimann et al.(1991)指出,摇摆小鼠精子发生的紊乱并不是由于睾丸下降受损或缺乏睾酮所致,并且与其他具有神经系统和精子发生缺陷的突变体中观察到的情况不同。 (例如,颤抖;见609590)。

Langeling et al.(1994)排除了2个候选基因Spnb2和Ddc作为wobbler脊髓性肌萎缩症基因。

Schmitt-John et al.(2005)将wobbler突变鉴定为小鼠Vps54基因第23号外显子中的自发A到T颠换,导致leu967到gln(L967Q)的取代。含有野生型 Vps54 基因的 BAC 在转基因 wobbler 小鼠中的表达挽救了神经系统和生精缺陷。Schmitt-John et al.(2005)发现,插入Vps54基因外显子4的X-gal报告基因的纯合表达在大约胚胎第12.5天时是胚胎致死的。对第 11.5 天 Vps54 -/- 胚胎的检查显示脊髓发育不全,背根神经节几乎完全缺失,心房和心室心肌发育不全。Schmitt-John et al.(2005)得出结论,Vps54 -/- 胚胎死于心血管功能障碍。

Perez-Victoria等人(2010)测定了小鼠Vps54 C端145个残基(氨基酸836至977)的晶体结构,发现L967完全埋藏在α-螺旋束上。带有 wobbler L967Q 突变的 Vps54 在 HeLa 细胞中过度表达后保留了功能;然而,突变型 Vps54 的稳定性不如野生型。蛋白质印迹分析显示纯合 wobbler 小鼠脊髓和肝脏中的 Vps54 蛋白减少。Wobbler 小鼠还表现出 Vps53 减少,Vps53 是内体到反式高尔基体逆行转运复合物的另一个成分。

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