转运蛋白颗粒复合物,子单元12; TRAPPC12
四三肽重复结构域蛋白 15;TTTC15
HGNC 批准的基因符号:TRAPPC12
细胞遗传学定位:2p25.3 基因组坐标(GRCh38):2:3,379,694-3,479,565(来自 NCBI)
▼ 说明
TRAPPC12 是参与细胞内囊泡运输的 TRAPP 多子单元束缚复合物的一个组成部分(Scrivens et al., 2011)。
▼ 克隆与表达
Scrivens et al.(2011)通过串联亲和纯化、SDS-PAGE 和质谱鉴定与 HEK293 细胞中的 TRAPPC2(300202)和 TRAPPC2L(610970)共纯化的蛋白质,鉴定出了 TRAPPC12。推导的蛋白质含有 4 个四肽重复,每个重复约 34 个氨基酸。通过 SDS-PAGE 检测,TRAAPPC12 的表观分子量为 79 kD。
▼ 基因功能
Scrivens et al.(2011)发现,通过干扰RNA去除HeLa细胞中的TRAAPPC12会导致高尔基体碎裂成分散的点并阻止顺行运输,这表明TRAAPPC12参与了内质网和高尔基体之间的早期运输事件。
▼ 测绘
Hartz(2011)根据TRAAPPC12序列(GenBank AF151845)与基因组序列(GRCh37)的比对,将TRAAPPC12基因定位到染色体2p25.3。
▼ 分子遗传学
来自2个无关家族的3名早发进行性脑病伴脑萎缩和痉挛的患者(PEBAS;617669),Milev et al.(2017)鉴定出TRAAPPC12基因的纯合或复合杂合突变(614139.0001-614139.0003)。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。来自所有 3 个个体的成纤维细胞均显示出片段化的高尔基体,可以通过表达野生型 TRAPPC12 来挽救。患者细胞还表现出有丝分裂延迟和蛋白质从内质网到高尔基体和通过高尔基体的运输延迟,这表明膜蛋白运输的缺陷是导致该疾病的原因。
▼ 等位基因变异体(3个精选例子):
.0001 脑病,进行性,早发,伴有脑萎缩和痉挛
TRAPPC12,1-BP DEL,145G
一名 21 个月大的男孩,父母为巴勒斯坦近亲,患有早发进行性脑病,伴有脑萎缩和痉挛(PEBAS;617669),Milev et al.(2017)在 TRAPPC12 基因中发现了一个纯合的 1-bp 缺失(c.145delG, NM_016030.5),导致移码和提前终止(Glu49ArgfsTer14)。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。在 ExAC 数据库或包含约 850 个穆斯林-阿拉伯外显子组的内部数据库中均未发现该基因。患者细胞的蛋白质印迹分析显示不存在 TRAPPC12 蛋白。
.0002 脑病,进行性,早发,伴有脑萎缩和痉挛
TRAPPC12,1-BP DUP,360C
两姐妹,由欧洲和美洲原住民混血背景的无亲缘关系父母所生,患有早发性进行性听力损失并伴有脑萎缩和痉挛(PEBAS;617669),Milev et al.(2017)鉴定了 TRAPPC12 基因中的复合杂合突变:1 bp 重复(c.360dupC,NM_016030.5),导致移码和提前终止(Glu121ArgfsTer7),以及 c.1880C -T转变,导致ala627-to-val(A627V; 614139.0003)替代。这些突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实,与家族中的疾病分开。根据 ExAC 数据库过滤变体;A627V 在 gnomAD 数据库中出现过两次,在 ExAC 数据库中出现的频率非常低。患者细胞的蛋白质印迹分析显示不存在 TRAPPC12 蛋白。
.0003 脑病,进行性,早发,伴有脑萎缩和痉挛
TRAPPC12、ALA627VAL(rs768950892)
讨论 TRAPPC12 基因中的 c.1880C-T 转变(c.1880C-T, NM_016030.5),导致 ala627-to-val(A627V)取代,在 2 姐妹的复合杂合状态中发现伴有脑萎缩和痉挛的早发进行性脑病(PEBAS;617669),Milev 等人(2017),参见 614139.0002。