肌氨酸脱氢酶; SARDH
SDH
HGNC 批准的基因符号:SARDH
细胞遗传学定位:9q34.2 基因组坐标(GRCh38):9:133,659,418-133,739,955(来自 NCBI)
▼ 说明
肌氨酸脱氢酶(SARDH;EC 1.5.99.1)是一种肝脏线粒体基质黄素酶,催化肌氨酸氧化去甲基化(Eschenbrenner 和 Jorns 总结,1999)。
▼ 克隆与表达
Eschenbrenner和Jorns(1999)通过同源性搜索鉴定出部分人类婴儿大脑SARDH cDNA。利用该部分 cDNA,他们分离出了全长的人类肝脏 cDNA。预测的 918 个氨基酸的 SARDH 蛋白包含一个假定的 22 个氨基酸的线粒体靶向序列、一个 ADP 结合位点,以及一段与来自大鼠肝脏 Sardh 的共价含黄素肽相匹配的 12 个氨基酸。人SARDH与大鼠肝脏Sardh有89%的氨基酸序列同一性,与大鼠肝脏二甲基甘氨酸脱氢酶有34%的同一性。对各种成人和胎儿组织的 Northern 印迹分析检测到,成人和胎儿肝脏中存在高水平的 4-kb SARDH 转录物,而成人胰腺、肾脏和胎儿肾脏中的水平较低。Eschenbrenner 和 Jorns(1999)鉴定了与可变剪接和多腺苷酸化 SARDH 转录物相对应的 cDNA。
▼ 基因结构
Eschenbrenner and Jorns(1999)确定SARDH基因跨度至少为75.3 kb,包含21个外显子。
▼ 测绘
Eschenbrenner and Jorns(1999)从9q34中鉴定出3条含有SARDH基因的基因组序列。人类 SARDH 基因在 9q34 的定位与使用肌氨酸血症 小鼠模型进行的遗传学研究一致,该模型将小鼠 Sardh 基因对应到染色体 2 的一个区域,该区域显示出与人类 9q33-q34 同线性的同源性(Harding 等人, 1992;Brunialti 等,1996)。
▼ 分子遗传学
来自 3 个以色列阿拉伯血亲家庭的 4 名个人和来自 3 个法国家庭的 3 名个人的血液和尿液中肌氨酸水平升高(SARCOS;Bar-joseph et al.(2012)对SARDH基因进行了测序,并鉴定出3个家族的纯合或复合杂合突变(604455.0001-604455.0004)。在一个法国家庭中,他们在 SARDH 基因区域发现了单亲二倍体。在两个以色列阿拉伯家族中未发现 SARDH 基因突变,表明存在遗传异质性。
▼ 等位基因变异体(4个精选例子):
.0001 肌氨酸血症
SARDH、VAL71PHE
两名以色列阿拉伯姐妹的血液和尿液中肌氨酸水平升高(SARCOS;Bar-joseph et al.(2012)对SARDH基因进行了测序,并鉴定出纯合的211G-T颠换,导致保守残基处的val71-to-phe(V71F)取代。268900)。
.0002 肌氨酸血症
SARDH、PRO287LEU
一名法裔加拿大人的血液和尿液中肌氨酸水平升高(SARCOS;Bar-joseph et al.(268900),Bar-joseph et al.(2012)对SARDH基因进行了测序,并鉴定了纯合的860C-T转变,导致保守残基处的pro287到leu(P287L)取代。
.0003 肌氨酸血症
SARDH、ARG723TER
一名具有德国和法国血统的个体的血液和尿液中肌氨酸水平升高(SARCOS;268900),Bar-joseph et al.(2012)对SARDH基因进行了测序,并鉴定出复合杂合突变:2167C-T转变导致arg723-to-ter(R723X)取代,1540C-T转变导致arg514 -to-ter(R514X)替代(604455.0004)。
.0004 肌氨酸血症
SARDH、ARG514TER
讨论血液和尿液中肌氨酸水平升高的患者(SARCOS; 268900),Bar-joseph 等人(2012),参见 604455.0003。