TAF6 RNA聚合酶II，TATA框结合蛋白相关因子，80-KD；TAF6

TATA框结合蛋白相关因子2E；TAF2E
TBP 相关因子，RNA 聚合酶 II，70- 至 85-KD
TAFII80
TAFII70
TAFII85

HGNC 批准的基因符号：TAF6

细胞遗传学定位：7q22.1 基因组坐标（GRCh38）：7:100,107,070-100,127,171（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

TFIID是一种必需的通用转录因子（GTF），它与II类启动子的TATA元件稳定结合，并将其他GTF（例如600519）和RNA聚合酶II（参见180660）组装成功能性预起始复合物。它由高度保守的TATA结合多肽（TBP；600075）和称为TBP相关因子（TAF）的紧密相关的多肽，它们是激活剂依赖性转录所必需的。Weinzierl等人（1993）通过用果蝇TAFII60 cDNA筛选HeLa细胞cDNA文库，孤立出编码TAF2E的cDNA，他们将其称为TAFII70。序列分析揭示了 3 个不同的 TAFII70 cDNA，作者认为它们对应于选择性剪接的转录本。人类基因组 DNA 的 Southern blot 分析证实 TAFII70 是一个单拷贝基因。预测的 3 个 TAFII70 蛋白有 667、677 和 726 个氨基酸；Weinzierl 等人（1993）选择了编码 677 个氨基酸亚型的 cDNA 进行进一步表征。重组TAFII70与TBP弱结合，与TAFII250（TAF2A; 313650），TFIID最大的子单元。在 TAFII70、TBP 和 TAFII250 存在下，形成稳定的三元复合物。

Hisatake等人（1995）孤立地分离了编码TAF2E的cDNA，他们将其称为TAFII80，通过使用基于TAFII80肽序列的“最佳猜测”寡核苷酸筛选人胎盘cDNA文库。Northern 印迹分析检测到 2.5 kb TAFII80 转录本。预测的蛋白质与Weinzierl等人（1993）推导的677个氨基酸的蛋白质相同。TAFII80 总体上富含脯氨酸，并且在其 C 末端具有富含丝氨酸、苏氨酸和脯氨酸的区域。TAFII80 和果蝇 TAFII60 蛋白在其 N 端和中央部分分别具有 50% 和 64% 序列同一性的保守区域。TAFII80 的 N 端 55 个氨基酸片段与组蛋白 H4 的区域有 24% 相同，据信该区域形成组蛋白八聚体的疏水核心的一部分。通过蛋白质印迹分析，HeLa 细胞提取物中的 TAFII80 的分子量为 80 kD。免疫共沉淀研究表明TAFII80与TBP、TAFII250、TAFII31（TAF2G；600822）、TAFII20（TAF2J；600773）, TFIIE-α（GTF2E1; 189962）、TFIIF-α（GTF2F1；189968）；Hisatake 等人（1995）在 TAFII80 中发现了 3 个参与这些相互作用的不同结构域。TAFII80 不与 TAFII55（TAF2F；600573）、TFIB（GTF2B；189963）, TFIIE-β（GTF2E2; 189964），或TFIIF-β（GTF2F2；189969）。

Bell等人（2001）克隆并鉴定了TAFII80-δ，TAFII80的一种特殊亚型。TAFII80-δ 在其组蛋白折叠基序的 α 螺旋-2 中心有 10 个氨基酸缺失。通过该缺失去除的氨基酸包括许多参与与TAFII31二聚化接触的残基。此外，TAFII80-δ cDNA 包含插入的反向 Alu 重复序列框，预计该框在开放解读码组的 N 末端编码额外的 49 个氨基酸。几种不同的细胞凋亡刺激诱导 TAFII80-δ 的表达和半胱天冬酶依赖性裂解。与 TAFII80 不同，TAFII80-δ 形成缺乏 TAFII31 的 TFIID 样复合物。HeLa 细胞中 TAFII80-δ 的表达升高足以触发细胞凋亡并选择性改变细胞转录，包括诱导靶基因 GADD45（126335）和 p21（116899）。这些数据定义了一条将细胞凋亡信号与 RNA 聚合酶 II 转录重编程结合起来的信号传导途径。

▼ 生化特征

冷冻电子显微镜

Bieniossek et al.（2013）提出了通过冷冻电子技术测定的人类核心-TFIID复合物的结构，该复合物由TAF4（601796）、TAF5（601787）、TAF6、TAF9（600822）和TAF12（600773）各2个拷贝组成分辨率为 11.6 埃的显微镜。该结构揭示了 2 倍对称、交错的结构，具有明显的突起，容纳了 TAF 的所有保守结构特征，包括组蛋白折叠。Bieniossek等人（2013）进一步证明，1个TAF8（609514）-TAF10（600475）复合物的结合破坏了核心-TFIID的原始对称性。Bieniossek et al.（2013）提出，所得的不对称结构可作为功能支架，通过增加剩余的 TAF 和 TBP 各 1 个拷贝，使 Holo-TFIID 组装成核。

▼ 测绘

国际辐射混合图谱联盟将TAF6（TAF2E）基因定位到染色体7（sts-F01487）。

▼ 分子遗传学

一名患有 Alazami-Yuan 综合征的男孩（ALYUS; Alazami et al.（2015）在TAF6基因中发现了一个纯合错义突变（I71T；617126）。602955.0001）。该家庭是由 143 个患有各种神经发育障碍的多重近亲家庭组成的大队列中的一部分，他们接受了全外显子组测序。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。

Yuan等人（2015）在一名近亲结婚的土耳其男孩中发现了TAF6基因的纯合错义突变（R46C；R46C；ALYUS）。602955.0002）。该患者属于 32 名土耳其临床诊断科妮莉亚·德·朗格综合征（CDLS；参见122470）接受了基因组测序。此外，Yuan等人（2015）孤立鉴定了来自Alazami等人（2015）研究的沙特近亲家族中患有类似疾病的3名同胞的TAF6 I71T突变。在两个家族中，这些突变都随着疾病的发生而分离。果蝇细胞系的体外功能表达研究表明，两种突变均减少了与 TFIID 复合物其他成分的结合相互作用，其中 I71T 变体比 R45C 表现出更有害的影响。将突变转染到酵母中会导致生长轻微但不明显的下降。这些发现与功能丧失一致，并表明该表型是由转录调控途径的变化引起的。

▼ 等位基因变异体（2个精选例子）：

.0001 阿拉扎米-元综合症

TAF6、ILE108THR

一名 11 岁沙特男孩，近亲结婚生（家族 11DG0932），患有 Alazami-Yuan 综合征（ALYUS; 617126），Alazami et al.（2015）在TAF6基因中发现了一个纯合的c.323T-C转换（c.323T-C, NM_001190415.1），导致ile108到thr（I108T）的取代。该突变是通过全外显子组测序发现的。未进行功能研究。

Yuan等人（2015）孤立地鉴定了一个纯合的c.212T-C转换（NM_005641.3），导致3个同胞（DG932、DG933和DG936）中的ile71到thr（I71T）被ALYUS取代Alazami 等人研究的同一家族（2015）。该突变是通过全外显子组测序发现的，在 516 个对照沙特外显子组中未发现，并且与该家族中的疾病分离。该突变在外显子组测序项目数据库中发现频率较低（0.008%）。取代发生在 N 末端区域组蛋白折叠的保守残基处。

.0002 阿拉扎米-元综合症

TAF6、ARG46CYS

一名 4 岁男孩，父母为土耳其近亲结婚，患有 Alazami-Yuan 综合征（ALYUS; 617126），Yuan et al.（2015）在TAF6基因中发现了纯合的c.136C-T转换（c.136C-T, NM_005641），导致保守残基处的arg46到cys（R46C）取代N 末端区域的组蛋白折叠。这种突变是通过全外显子组测序发现的，在任何对照数据库中都没有发现，并且与家族中的疾病分离。