AAR2 剪接因子;AAR2
AAR2 剪接因子,酿酒酵母,同源物
染色体 20 开放解读码组 4; C20ORF4
HGNC 批准的基因符号:AAR2
细胞遗传学定位:20q11.23 基因组坐标(GRCh38):20:36,236,478-36,256,933(来自 NCBI)
▼ 说明
在酵母中,Brr2(SNRNP200; 601664)是前体mRNA剪接中催化激活U5(参见RNU5A,180691)剪接体所必需的解旋酶。酵母Aar2通过与U5特异性剪接体蛋白Prp8(PRPF8;PRPF8;607300)并排除剪接体复合物中Brr2与Prp8的相互作用(Santos等人总结,2015)。
▼ 克隆与表达
Santos等人(2015)以酵母Aar2作为查询检索人类数据库,鉴定了AAR2,并获得了全长AAR2克隆。推导的 384 个氨基酸蛋白与酵母 Aar2 仅具有 20% 的同一性和 35% 的相似性。HeLa 细胞的蛋白质印迹分析检测到表观分子质量约为 45 kD 的内源性 AAR2。
▼ 基因功能
Santos等人(2015)使用纯化的蛋白质发现,与酵母Aar2类似,全长体外翻译的人AAR2与重组人PRP8的分离的C端RNaseH(参见RNASEH1, 604123)结构域结合。蛋白酶消化研究表明,尽管酵母和人 AAR2 之间的序列相似性较低,但它们具有相似的折叠和结构域结构,并且 N 端和 C 端结构域大小大致相等。
▼ 测绘
Hartz(2017)根据AAR2序列(GenBank AL117419)与基因组序列(GRCh38)的比对,将AAR2基因定位到染色体20q11.23。