富含亮氨酸重复、免疫球蛋白样和跨膜结构域的蛋白质 3;LRIT3

FIGLER4

HGNC 批准的基因符号:LRIT3

细胞遗传学定位:4q25 基因组坐标(GRCh38):4:109,848,107-109,872,315(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Kim等人(2012)通过对人成骨细胞cDNA文库进行PCR,克隆了全长LRIT3。推导的蛋白质包含一个N端信号序列,随后是一个富含亮氨酸的重复区域、一个免疫球蛋白样结构域、一个纤连蛋白(参见135600)III型结构域、一个跨膜结构域和一个短的C端尾部。LRIT3预计驻留在内质网(ER)中或在内质网和顺式高尔基体之间快速循环。

通过实时PCR实验,然后对扩增的实时PCR产物进行桑格测序,Zeitz等人(2013)证明了LRIT3在人视网膜中的表达。作者指出,这证实了 LRIT3 的 UniGene 表达序列标签(EST)图谱,表明在大脑和眼睛中表达。

▼ 测绘

Hartz(2013)根据LRIT3序列(GenBank AK126648)与基因组序列(GRCh37)的比对,将LRIT3基因定位到染色体4q25。

▼ 基因功能

Kim et al.(2012)发现LRIT3调节FGFR1(136350)信号并增强FGFR1的高尔基体修饰形式。LRIT3不增强碱性FGF(FGF2;134920)依赖性ERK1(601795)/ERK2(176948)磷酸化,但增加了FGF2非依赖性磷脂酶C-γ磷酸化(见172420)。

Zeitz 等人(2013)在人视网膜中进行了 LRIT3 抗体染色,并在去极化双极细胞的树突处观察到特征性突触点状标记,其模式类似于在完全先天性静止性夜盲症中所见的其他蛋白质(参见 CSNB1F, 615058)。

▼ 分子遗传学

2例完全先天性静止性夜盲症患者(CSNB1F;615058),Zeitz et al.(2013)鉴定了LRIT3基因突变的复合杂合性(615004.0001-615004.0004)。这些突变在两个家族中均随疾病而分离,并且在 340 多个对照染色体中未发现。

▼ 动物模型

Neuille et al.(2014)发现Lrit3 -/- 小鼠没有表现出明显的表型,但视网膜电图显示分别在暗视和明视条件下b波振幅缺失或减少。Lrit3 -/- 小鼠也表现出暗视视运动反应减少。Lrit3 -/- 视网膜的谱域光学相干断层扫描显示内核层和部分内丛状层、神经节细胞层和神经纤维层变薄,但没有其他视网膜异常或眼底自发荧光。由于其表型,Neuille et al.(2015)将Lrit3 -/- 小鼠称为“无b波6”(nob6)小鼠。作者得出结论,nob6 小鼠的视觉功能障碍同时影响视杆细胞和视锥细胞 ON-双极细胞,可能与 ON-双极细胞表面 Trpm1 通道(603576)的缺乏有关。

Neuille et al.(2015)利用免疫荧光共聚焦显微镜发现Lrit3与Glur6(GRIK2; 138244)位于野生型小鼠视网膜的外丛状层。 Lrit3 -/- 视网膜中不存在 Lrit3 和 Glur6 染色。 Lrit3 -/- 视网膜中所有去极化双极细胞的树突尖端 Trpm1 染色严重减少。 ON-双极细胞信号级联的其他成分,包括Gpr179(614515)、Rgs7(602517)、Rgs11(603895)和G-β-5(GNB5); 604447)存在于 Lrit3 -/- 小鼠视杆双极细胞中,但在视锥 ON-双极细胞的树突尖端不存在。 Neuille et al.(2015)得出结论,Lrit3对于Trpm1和锥体ON-双极细胞信号级联的组件的正确定位是必需的。

▼ 等位基因变异体(4个精选例子):

.0001 夜盲症,先天性固定,1F 型

LRIT3、CYS328TYR

一名 45 岁女性,患有完全先天性静止性夜盲症(CSNB1F;615058),Zeitz et al.(2013)鉴定了LRIT3基因中的复合杂合突变:外显子4中的983G-A转换,导致高度保守残基处的cys328-to-tyr(C328Y)取代,以及1318C-外显子 4 中的 T 转换,导致 arg440-to-ter(R440X) 取代。在她未患病的兄弟和父亲身上发现了 C328Y 杂合突变;她的母亲去世了。在 340 多个对照染色体中均未检测到这两种突变;C328Y 在 NHLBI 外显子组测序项目数据库中发现的频率非常低(10,757 个等位基因中的 1 个),但在任何公开数据库中都没有发现 R440X。

.0002 夜盲症,先天性固定,1F 型

LRIT3、ARG440TER

讨论 LRIT3 基因中的 1318C-T 转变,导致 arg440-to-ter(R440X) 取代,这种取代在先天性静止性夜盲症(CSNB1F)患者的复合杂合状态下发现;615058),Zeitz 等人(2013),参见 615004.0001。

.0003 夜盲症,先天性固定,1F 型

LRIT3、SER384TER

一名9岁女孩患有完全性先天性静止性夜盲症(CSNB1F;615058),Zeitz et al.(2013)鉴定出LRIT3基因中的复合杂合突变:外显子4中的1151C-G颠换,导致ser384-to-ter(S384X)取代,以及2-bp缺失(1538_1539del;615004.0004)位于外显子 4 中,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ser513CysfsTer59)。这两种变异都与家族中的表型共分离,并且在超过 370 个对照染色体或 NHLBI 外显子组测序项目数据库中均未发现。

.0004 夜盲症,先天性固定,1F 型

LRIT3、2-BP DEL、NT1538

讨论先天性静止性夜盲症(CSNB1F)患者复合杂合状态下发现的LRIT3基因第4外显子2-bp缺失(1538_1539del);615058),Zeitz 等人(2013),参见 615004.0003。

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