SIN3A 相关蛋白,130-KD;SAP130
HGNC 批准基因符号:SAP130
细胞遗传学定位:2q14.3 基因组坐标(GRCh38):2:127,941,222-128,028,059(来自 NCBI)
▼ 说明
SAP130 是组蛋白脱乙酰酶的一个子单元(参见 HDAC1;601241)依赖的SIN3A(607776)辅阻遏物复合物(Fleischer et al., 2003)。
▼ 克隆与表达
Fleischer等人(2003)从K562人红白血病细胞中纯化了SIN3A复合物。通过对与复合物相关的多肽进行微测序,然后进行数据库分析,他们获得了全长 SAP130。推导的 1,048 个氨基酸的蛋白质在其 N 端和 C 端半部分具有富含脯氨酸的结构域。体外分析产生表观分子量为 130 kD 的蛋白质。Northern 印迹分析在所有检查的人类细胞系中检测到 4.4 kb 的转录物。
▼ 测绘
Stumpf(2021)根据SAP130序列(GenBank BC117255)与基因组序列(GRCh38)的比对,将SAP130基因定位到染色体2q14.3。
▼ 基因功能
Fleischer等(2003)通过对K562红白血病细胞进行免疫沉淀,证实SAP130是SIN3A复合体的成员。除SIN3A外,与SAP130免疫共沉淀的其他蛋白还包括SAP180(609696)、SDS3(608250)、HDAC1和HDAC2(605164)。表位标记蛋白的免疫沉淀表明 SAP130 和 SAP180 可以占据相同的 SIN3A 复合物,并且两种蛋白均结合 SIN3A 的 C 端 HDAC 相互作用结构域。SAP130 还结合缺乏 HDAC 相互作用结构域的 SIN3A,表明在 SIN3A 的 N 端一半存在第二个结合位点。当靶向 DNA 时,SAP130 和 SAP180 都会抑制转录。SIN3A 和 HDAC1 与 SAP130 的 C 末端结合,所有能够结合 SIN3A 和 HDAC1 的截短 SAP130 蛋白都会免疫沉淀 HDAC 酶活性并抑制转录。Fleischer et al.(2003)得出结论,SAP130 的抑制取决于其与 SIN3A-HDAC 复合体的关联。
▼ 分子遗传学
关联待确认
有关 SAP130 基因变异与左心发育不全综合征之间可能关联的讨论,请参阅 241550。
▼ 历史
Metselaar 等人(2021)注意到 Seifert 等人(2016)的一篇文章所产生的混淆,其中 SF3B3 仅被指定为“SAP130”。作者发表了一个勘误表,该文章已从该条目移至605592。