TBC1 域家族,成员 3;TBC1D3
TBC1D3A
HGNC 批准的基因符号:TBC1D3
细胞遗传学定位:17q12 基因组坐标(GRCh38):17:38,181,659-38,192,555(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Paulding et al.(2003)通过基因组序列分析鉴定出TBC1D3。推导的蛋白质包含在参与 RAB(参见 179508)GTPase 信号传导的蛋白质中发现的 TBC 结构域。对 15 种人体组织进行 RT-PCR 分析,检测到 TBC1D3 在肝脏、骨骼肌、肾脏、胰腺、脾脏、睾丸、卵巢、小肠和外周血白细胞中的表达。
Hodzic等人(2006)通过基因组序列分析,在染色体17上鉴定了TBC1D3基因的8个旁系同源物,其中包括TBC1D3,他们将其称为旁系同源物H。所有TBC1D3旁系同源物编码推导的549个氨基酸的蛋白质,但在6个残基处发生错义变化旁系同源物中产生 5 种不同的 TBC1D3 亚型。TBC1D3 旁系同源物似乎在人体组织中存在差异表达。TBC1D3 是心脏中表达的唯一旁系同源物。
▼ 测绘
Paulding et al.(2003)通过基因组序列分析,将TBC1D3基因定位到染色体17q12。基因组组装(build 35.1)表明在同一区域存在几乎相同的重复位点TBC1D3B(610144)(Scott,2005)。
Hodzic等(2006)通过基因组序列分析,在染色体17q12上鉴定出8个TBC1D3旁系同源物,包括TBC1D3基因。旁系同源物分为 2 组,每组 4 个基因,每个簇的大小约为 400 kb。
▼ 进化
Paulding et al.(2003)确定TRE2癌基因(USP6;604334)源自USP32基因(607740)与TBC1D3基因的嵌合融合。USP32 是一个古老、高度保守的基因,而 TBC1D3 源自最近的片段复制,这种复制在大多数其他哺乳动物中都不存在,并且在灵长类谱系中表现出快速扩增和扩散。嵌合 TRE2 基因仅存在于灵长类类人猿谱系中,并且在 TBC1D3 节段复制增殖后于 21 至 3300 万年前出现。与 USP32 和 TBC1D3 的广泛表达模式相反,TRE2 的表达是睾丸特异性的,这是一种与生殖障碍出现有关的基因的模式。作者得出的结论是,嵌合蛋白(例如由 TRE2 编码的蛋白)的突然出现可能有助于类人猿物种形成。