含热重复蛋白 3; HEATR3

同步导入蛋白1;SYO1
SYMPORTIN

HGNC 批准的基因符号:HEATR3

细胞遗传学定位:16q12.1 基因组坐标(GRCh38):16:50,065,970-50,107,272(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Kressler 等人(2012)克隆了酿酒酵母和嗜热酿酒酵母 Syo1,并在所有其他检查物种(包括人类)中鉴定了直向同源物。Syo1 包含多个 ARM 和 HEAT 重复序列。

▼ 生化特征

Kressler et al.(2012)以2.1埃的分辨率测定了C.thermophilum Syo1的晶体结构。他们发现 Syo1 形成了 α-螺旋超螺旋或 α-螺线管,这是核转运受体的典型特征。

▼ 基因功能

核糖体蛋白和RNA以有序的方式组装成核糖体。核糖体蛋白通过转运受体输入细胞核,并通过RanGTP(601179)从其转运蛋白中释放出来。Kressler et al.(2012)利用酿酒酵母和嗜热酿酒酵母表明,Syo1促进5S rRNA(RN5S1;RN5S1;180420)-结合蛋白Rpl5(603634)和Rpl11(604175)以依赖于输入受体Kap104(人TNPO1(602901)的直系同源物)的方式。RanGTP 与细胞核中 Kap104 的结合介导 Syo1-Rpl5-Rpl11 复合物的释放,从而招募 5S RNA。

▼ 测绘

Gross(2012)根据HEATR3序列(GenBank BC018730)与基因组序列(GRCh37)的比对,将HEATR3基因定位到染色体16q12.1。

▼ 分子遗传学

6例Diamond-Blackfan贫血21(DBA21;O\'Donohue et al.(2022)通过外显子组测序鉴定了 HEATR3 基因中的双等位变异体(620072),来自 4 个科。其中3个家系中,受影响的患者为错义突变纯合性(614951.0001-614951.0003),1个家系中发现错义突变(614951.0004)和剪接位点突变(614951.0005)的复合杂合性。这些发现得到了桑格测序的证实。在携带C446Y(614951.0002)和G584E(614951.0001)变异的患者样本中,HEATR3 mRNA水平正常,但HEATR3蛋白水平几乎检测不到,表明这些变异导致蛋白质不稳定。在 HEATR3 缺失的细胞和患者来源的成纤维细胞中,核糖体蛋白 uL18(RPL5;603634)减少了。表达 HEATR3 变体的造血祖细胞表现出红细胞成熟异常加速和增殖能力丧失,这似乎与 p53(191170)激活无关。

▼ 等位基因变异体(5个精选例子):

.0001 钻石-黑风扇贫血 21

HEATR3、GLY584GLU

2 名同胞(P1 和 P2)患有 Diamond-Blackfan 贫血-21(DBA21;O\'Donohue et al.(2022)鉴定了 HEATR3 基因中 c.1751G-A 颠换(c.1751G-A, NM_182922)的纯合性,从而产生了HEAT重复结构域中的gly584-to-glu(G584E)替换。父母双方都是该变异的杂合子,在 gnomAD 数据库中未发现该变异。在患者类淋巴母细胞中,HEATR3 mRNA 水平正常,但几乎检测不到 HEATR3 蛋白水平,表明这种变异导致蛋白不稳定。P2期真皮成纤维细胞核糖体蛋白uL18(RPL5;603634)。从 P2 骨髓中纯化的 CD34+ 细胞的红系细胞培养物显示红细胞成熟异常加速和增殖能力丧失,这似乎与 p53(191170)激活无关。

.0002 钻石-黑风扇贫血 21

HEATR3、CYS446TYR

一名17岁男孩(P3)患有Diamond-Blackfan贫血-21(DBA21;620072),其出生于土耳其血统的近亲父母,O\'Donohue等人(2022)鉴定出HEATR3基因外显子10中的c.1337G-A转换(c.1337G-A,NM_182922)纯合性,导致 HEAT 重复结构域中的 cys446 替换为 tyr(C446Y)。在 gnomAD 数据库中未找到该变体。在患者类淋巴母细胞中,HEATR3 mRNA 水平正常,但几乎检测不到 HEATR3 蛋白水平,表明这种变异导致蛋白不稳定。

.0003 钻石-黑粉丝贫血 21

HEATR3、CYS134ARG

2 名荷兰同胞(P5 和 P6)患有 Diamond-Blackfan 贫血-21(DBA21;620072),O\'Donohue et al.(2022)鉴定了 HEATR3 基因外显子 4 中 c.400T-C 转换(c.400T-C, NM_182922)的纯合性,产生 cys134-to-arg(C134R) ) ARM 重复域中的替换。父母双方都是该变异的杂合子。该变异在 gnomAD 数据库中被发现,等位基因频率较低,且仅存在杂合性。

.0004 钻石-黑风扇贫血 21

HEATR3、PRO240LEU

11岁男孩(P4)患有Diamond-Blackfan贫血-21(DBA21;620072),其父母为非近亲法国人,O\'Donohue et al.(2022)鉴定了该基因第 6 号外显子中 c.719C-to-T 转变(c.719C-to-T, NM_182922)的复合杂合性。 HEATR3 基因,导致 ARM 重复结构域中 pro240 替换为 leu(P240L),以及内含子 3(c.399+1G-T)中的典型剪接位点变异。每个亲本都显示出其中一种变体的杂合性。在 gnomAD 数据库中未发现这些变体。从患者外周血中纯化的 CD34+ 细胞显示出红细胞增殖的严重缺陷。

.0005 钻石-黑风扇贫血 21

HEATR3、IVS3、GT、+1

讨论Diamond-Blackfan贫血21(DBA21;620072),O\'Donohue 等人(2022),参见 614951.0004。

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