原钙粘蛋白-β 16; PCDHB16

PCDH-β-16
PCDHB8A
KIAA1621

HGNC 批准的基因符号:PCDHB16

细胞遗传学定位:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:141,182,387-141,186,226(来自 NCBI)

▼ 说明

钙粘蛋白是介导神经细胞间相互作用的钙依赖性细胞间粘附分子。原钙粘蛋白构成非经典钙粘蛋白的一个亚家族。PCDHB16 是 5q31 上原钙粘蛋白基因 β 簇的成员。有关 PCDHB 基因的具体信息,请参阅 604967。

▼ 克隆与表达

Matsuyoshi等人(1997)利用简并引物PCR筛选黑色素瘤细胞系,获得了编码PCDHB16部分的cDNA片段,他们将其命名为ME1。RT-PCR分析检测到ME1在黑色素瘤细胞系和正常成纤维细胞系中表达,但在鳞状癌细胞系或正常黑色素细胞中没有表达,表明ME1可能在黑色素瘤细胞的强细胞粘附性中发挥作用。

通过筛选大脑 cDNA 文库中可能编码大蛋白的序列,Nagase 等人(2000)分离出了编码 PCDHB16 的 cDNA,他们将其命名为 KIAA1621。序列分析预测,由 787 个氨基酸组成的 KIAA1621 蛋白与 PCDH13 具有 79% 的一致性,具有参与细胞信号传导和通讯的蛋白质的特征。RT-PCR 分析检测到广泛但中等的表达,在肝脏和脾脏中表达最低。

▼ 测绘

Nagase等(2000)通过辐射杂交分析将PCDHB16基因定位到染色体5。通过基因组序列分析,Wu等(2001)将PCDHB16基因定位到5q31。他们将小鼠 PCDHB 基因定位到染色体 18c。

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