完整膜蛋白 2C;ITM2C

BRI3

HGNC 批准基因符号:ITM2C

细胞遗传学定位:2q37.1 基因组坐标(GRCh38):2:230,864,185-230,879,254(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

整合膜蛋白家族(ITMs,例如ITM2B,603904)由具有胞外C末端的整合II型膜糖蛋白组成。Vidal等人(2001)利用序列分析和5-prime和3-prime RACE,孤立出了整合膜蛋白2C(ITM2C,作者称为BRI3)对应的cDNA,并表明其编码267个氨基酸计算分子量为 30.2 kD 的酸性蛋白。ITM2C 与其他人类和鼠 ITM 家族成员共享多个保守特征,包括 1 个 N-糖基化和 2 个磷酸化位点以及单个跨膜结构域。Itm2c 与人类 ITM2C 具有 92.9% 的氨基酸同一性。ITM2C 与 ITM2B 有 43.7% 的氨基酸同一性,其中 C 端部分的同一性最高。EST 同源性搜索鉴定出编码 219 个氨基酸 ITM2C 剪接变体的克隆。ITM2C 的启动子区域富含 GC,包含 3 个 SP1 和 5 个 AP-1 结合位点。Northern 印迹分析显示 2.1 kb ITM2C 转录本在大脑中强表达,而在其他几个组织中表达非常弱。

▼ 基因功能

Wickham等人(2005)以β-淀粉样蛋白转换酶BACE(604252)的C端为诱饵,利用酵母2-杂交分析人脑文库,发现ITM2C是一种相互作用蛋白。免疫共沉淀实验证实了 ITM2C 和 BACE 的相互作用。Wickham等(2005)通过原位杂交发现ITM2C在小鼠大脑中广泛表达,特别是在海马、皮质、小脑、嗅叶和纹状体中。原位杂交分析表明,ITM2C 和 BACE 在阿尔茨海默病患者、正常小鼠和阿尔茨海默病小鼠模型的大脑中以重叠模式表达。一系列脉冲追踪实验表明,ITM2C 被切割成大约 4-kD C 端分泌产物,弗林蛋白酶(136950)、PC7(604872)和 PC5A(600488)等转化酶负责这个分裂。

▼ 基因结构

Vidal等(2001)通过基因组序列比对表明,ITM2C基因包含6个外显子,跨度超过20 kb。

▼ 测绘

Vidal 等人(2001)在基因组克隆中鉴定了 ITM2C 基因,对应到染色体 2。

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