SPARC/骨连接素、CWCV 和 KAZAL 样结构域蛋白聚糖; SPOCK1

SPOCK
TESTICAN

HGNC 批准的基因符号:SPOCK1

细胞遗传学定位:5q31.2 基因组坐标(GRCh38):5:136,975,298-137,499,326(来自 NCBI)

▼ Description

蛋白聚糖由核心蛋白和共价连接的糖胺聚糖组成,是细胞外基质的组成部分。SPOCK编码一个新的Ca(2+)结合蛋白聚糖家族的成员(Vannahme等人总结,1999)。

▼ 克隆与表达

睾丸蛋白是从人精浆中分离出来的硫酸软骨素/硫酸乙酰肝素蛋白多糖(Bonnet et al., 1992)。Alliel等人(1993)使用基于纯化蛋白多糖氨基酸序列的探针从人睾丸cDNA文库中克隆了SPOCK cDNA,他们将其称为睾丸。SPOCK cDNA 编码推导的 439 个氨基酸的蛋白质,具有预测的 N 端信号序列和 2 个共有糖胺聚糖附着位点。SPOCK包含骨连接蛋白样结构域、Kazal样序列和cys-trp-cys-val(CWCV)结构域,与参与粘附、迁移和细胞增殖的蛋白质家族相关。

Bonnet et al.(1996)克隆了小鼠同源物Spock1。人类和小鼠蛋白质具有 95% 的序列同一性。原位杂交表明,Spock1主要位于海马CA3区的锥体神经元亚群中。免疫细胞化学研究表明 Spock1 与这些锥体神经元的突触后区域相关。

Charbonnier等人(1997)通过对成年小鼠组织的Northern blot分析,仅在大脑中检测到Spock的强表达。原位杂交和免疫组织化学分析揭示了 Spock 在小鼠大脑的离散区域中的分布,包括海马和小脑的 CA3 区域。免疫电镜显示 Spock 定位于分散的锥体神经元和浦肯野细胞的突触后密度中。

▼ 基因结构

Charbonnier et al.(1998)确定SPOCK基因包含11个外显子,跨度70 kb。

▼ 测绘

Charbonnier等人(1998)通过原位杂交和YAC作图将SPOCK孤立连接至IL9(146931)和EGR1(128990)基因之间的5q31。Charbonnier et al.(1998)指出,SPOCK基因较早定位于染色体21(Cheng et al., 1994)可能反映了相关基因的错误识别。

▼ 分子遗传学

有关 SPOCK1 基因变异与神经发育表型之间可能关联的讨论,请参阅 602264.0001。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 意义不明的变体

斯波克1、ASP80VAL

该变异被归类为意义不明的变异,因为其对发育迟缓、新生儿小头畸形和胼胝体部分发育不全的影响尚未得到证实。

在一名患有精神运动发育迟缓、新生儿小头畸形(-2 SD)和胼胝体部分发育不全的 13 岁女孩中,Dhamija 等人(2014)在 SPOCK1 中发现了一个从头杂合的 c.239A-T 转变。基因,导致高度保守的残基处由 asp80 替换为 val(D80V)。该突变是通过全外显子组测序发现并通过桑格测序确认的,并与 dbSNP(build 137)和千人基因组计划数据库进行了检查。没有对该变体进行功能研究。患者的其他特征包括智力障碍、构音障碍、肌张力障碍、肢体张力亢进、轴向肌张力减退、异常的右锁骨下动脉以及微妙的畸形特征,如圆脸、小下巴、鼻不对称、乳头间距宽、手指长而锥形。随着年龄的增长,她的头围有所改善。该表型与静态脑病一致,没有消退迹象。

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