斑萎蛋白 2; BEST2
- VMD2 样基因 1;VMD2L1
HGNC 批准的基因符号:BEST2
细胞遗传学定位:19p13.13 基因组坐标(GRCh38):19:12,751,791-12,758,458(来自 NCBI)
▼ 说明
BEST2属于阴离子通道斑萎蛋白家族,该家族包括卵黄样黄斑营养不良(VMD;VMD)的基因突变体BEST1(607854)。153700),以及另外2个BEST1样基因,BEST3(607337)和BEST4(607336)。斑斑蛋白是跨膜(TM)蛋白,它们共享一个含有高含量芳香族残基的同源区域,包括一个不变的arg-phe-pro(RFP)基序。斑紫蛋白基因具有保守的基因结构,8 个 RFP-TM 结构域编码外显子的大小几乎相同,并且外显子-内含子边界高度保守。4个斑紫蛋白基因中的每一个都有一个独特的可变长度的3-prime末端(Stohr et al., 2002; Tsunenari 等,2003)。
▼ 克隆与表达
Stohr et al.(2002)利用VMD2基因的cDNA对人类基因组草图序列进行BLAST搜索,在染色体19上鉴定出一个同源区域。通过应用EST组装策略并对相应的cDNA克隆进行测序,确定了cDNA序列VMD2L1 基因。开放阅读码组编码了一种推定的 509 个氨基酸的蛋白质,计算出的分子量为 57.1 kD。该基因的转录主要局限于视网膜色素上皮和结肠。VMD2基因产物已定位于视网膜色素上皮的基底外侧膜(Marmorstein et al., 2000)。Stohr et al.(2002)指出,可以想象,其他RFP-TM蛋白可能在具有极化表型的细胞中发挥功能,可能作为参与分子矢量定向运输的受体。
Pifferi et al.(2006)通过RT-PCR,在小鼠嗅上皮细胞中仅检测到Best2,而没有检测到其他斑紫斑。单细胞 RT-PCR 显示 Best2 在嗅觉感觉神经元中表达,但在支持细胞中不表达。免疫组织化学分析显示Best2表达于嗅觉感觉神经元纤毛上,即嗅觉转导部位,且Best2与Cnga2(300338)共定位。
▼ 基因功能
Pifferi et al.(2006)利用电生理记录发现,小鼠嗅觉感觉神经元纤毛的天然通道和Best2转染的人胚胎肾细胞中的天然通道表现出相同的阴离子通透性序列、单通道电导、相似的Ca(2+)敏感性,以及与 2 种氯离子通道阻滞剂相同的侧特异性通道阻滞作用。Pifferi et al.(2006)得出结论,BEST2是嗅觉钙激活氯离子通道的分子成分。
▼ 基因结构
Stohr et al.(2002)指出BEST2基因覆盖了5.9 kb的基因组DNA。
▼ 测绘
Stohr et al.(2002)通过对人类中期扩散进行FISH,将BEST2细化到染色体19p13.2-p13.12的定位。