唐氏综合症关键区域基因 8;DSCR8

恶性黑色素瘤相关蛋白 1; MMA1

HGNC 批准的基因符号:DSCR8

细胞遗传学定位:21q22.13 基因组坐标(GRCh38):21:38,121,451-38,156,511(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

de Wit et al.(2002)利用阵列分析识别在转移性和非转移性人类黑色素瘤细胞系中差异表达的基因,然后进行EST数据库分析和PCR,克隆了DSCR8的2个剪接变体,他们将其命名为MMA1A和MMA1B。全长 91 个氨基酸的 MMA1A 蛋白的计算分子量为 10 kD。它有 3 个磷酸化位点和 1 个 N-肉豆蔻酰化位点。MMA1B 转录物缺乏外显子 3,编码推导的 37 个氨基酸蛋白质,计算得出的分子量为 4 kD。MMA1B 有一个磷酸化位点。对 20 个组织的 RT-PCR 分析在睾丸中检测到了两种 MMA1 转录本,但在所检查的任何其他组织中均未检测到。巢式 PCR 显示其他一些组织中 MMA1A 和/或 MMA1B 水平较低。

de Wit 等人(2005)使用 RT-PCR,在恶性黑色素瘤中鉴定了 4 个额外的 MMA1 剪接变体,他们将其命名为 MMA1C 至 MMA1F。这些转录本的不同之处在于外显子 3 是否存在以及内含子 2 中选择性剪接位点的选择。选择性剪接改变了外显子 2 和 3 的长度以及阅读框。推导的蛋白质含有41至97个氨基酸。巢式 PCR 分析显示睾丸中存在 MMA1C 至 MMA1E,但在检查的任何其他正常组织中均未发现 MMA1C 至 MMA1E。仅在 1 个恶性黑色素瘤样本中检测到 MMA1F,表明 MMA1F 中使用的剪接位点可能是突变的结果。数据库分析显示 MMA1 的直系同源物仅存在于黑猩猩中。

Dunn et al.(2006)发现DSCR4(604829)和DSCR8基因由双向启动子转录,并表现出相似的表达模式。RT-PCR 随后进行 Southern 印迹分析,在前列腺、骨骼肌、睾丸和胎盘中检测到 2 个 DSCR4 转录本和 4 个 DSCR8 转录本。在胸腺中单独检测到 DSCR4 的强表达,而在脑、肾和骨髓中单独检测到低水平的 DSCR8。在胎盘和睾丸畸胎瘤细胞系中也检测到了 DSCR4 和 DSCR8 转录本,但在 HeLa 细胞中未检测到。Dunn et al.(2006)发现DSCR4和DSCR8似乎仅在灵长类动物中进化,尽管DSCR4在旧世界猴中没有发现。双向启动子在灵长类动物中似乎也高度保守。

▼ 基因功能

de Wit et al.(2002)利用PCR分析在20%的原发性黑色素瘤和约30%的黑色素瘤转移中检测到MMA1A和MMA1B转录本,表明在恶性进展过程中出现表达。PCR分析还在回肠、食道和乳腺的一些肿瘤病变、几种恶性黑色素瘤细胞系以及肺、肝、结肠和膀胱的肿瘤细胞系中检测到MMA1。

de Wit et al.(2005)通过检查MMA1在黑色素细胞肿瘤进展系列中的表达,发现所有MMA1剪接变体优选在最晚期的恶性黑色素瘤中表达。

▼ 基因结构

De Wit et al.(2002)确定DSCR8基因包含4个外显子,跨度为35 kb。外显子 1 是非编码的。

De Wit et al.(2005)确定DSCR8基因的启动子区域缺少传统的TATA框或CAAT位点,但它包含多个转录因子的推定结合位点。CpG 岛与启动子区域和外显子 1 重叠。外显子 3 包含 Alu 元件。

Dunn et al.(2006)在DSCR4和DSCR8基因之间鉴定了一个双向启动子,这两个基因以相反的方向转录。它们的转录起始位点和第一个外显子位于复合内源逆转录病毒(ERV)元件内,其中ERV1长末端重复序列(LTR)被插入并分裂旧的ERV-L LTR。这两个基因在其整个长度上都富含重复序列:DSCR4 的外显子 2 完全源自 ERV-LTR,而 DSCR8 外显子 2 包含短 MIR 片段,DSCR8 外显子 3 完全源自 Alu 元件。该双向启动子的LTR包含2个推测的SP1(189906)结合位点和一个cAMP响应元件,在功能研究中具有高度活性,显示出多个正向和负向调节元件。

▼ 测绘

de Wit et al.(2002)通过基因组序列分析,将DSCR8基因定位到染色体21q22.2。

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