HOXA 簇反义 RNA 2,非编码; HOXAAS2

长基因间非编码 RNA HOXAAS2
lincRNA HOXAAS2

HGNC 批准的基因符号:HOXA-AS2

细胞遗传学定位:7p15.2 基因组坐标(GRCh38):7:27,121,919-27,128,760(来自 NCBI)

▼ 说明

长基因间非编码RNA(lincRNA),例如HOXAAS2,长度超过200个核苷酸,从编码基因之间的位点转录。大多数lincRNA在发育和细胞分化过程中具有调节基因表达的作用(Zhao et al., 2013总结)。

▼ 克隆与表达

Chao et al.(2013)报道HOXAAS2被剪接成多个变体,长度从339到2,045个核苷酸不等。

▼ 基因功能

赵等人(2013)利用RNA深度测序发现,全反式维甲酸(ATRA)在NB4早幼粒细胞白血病细胞和正常人外周血中性粒细胞中诱导HOXAAS2表达。定量RT-PCR检测中性粒细胞中HOXAAS2响应IFN-γ(IFNG;147570)早和去TNF-α(TNF; 191160)稍后。NB4细胞中HOXAAS2的敲低导致ATRA通过TRAIL(TNFSF10;TNFSF10;603598)介导的细胞凋亡。

▼ 基因结构

赵等人(2013)报道HOXAAS2基因含有2个外显子。

▼ 测绘

赵等人(2013)报道HOXAAS2基因定位于染色体7p15.2,位于相反链上的HOXA3(142954)和HOXA4(142953)基因之间。

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