免疫球蛋白超家族,成员 11;IGSF11
脑和睾丸特异性免疫球蛋白超家族蛋白;BTIGSF
V-SET 和含免疫球蛋白结构域的蛋白质 3;VSIG3
HGNC 批准的基因符号:IGSF11
细胞遗传学定位:3q13.32 基因组坐标(GRCh38):3:118,900,557-119,146,020(来自 NCBI)
▼ 说明
IGSF11是免疫球蛋白(Ig)超家族成员,优先在脑和睾丸中表达。与柯萨奇病毒和腺病毒受体(CXADR;602621)和内皮细胞选择性粘附分子(ESAM;614281)(Suzu et al., 2002)。
▼ 克隆与表达
通过检索EST数据库寻找MCSFR(CSF1R;164770),随后通过肾脏cDNA文库的5-prime和3-prime RACE,Suzu等人(2002)克隆了IGSF11,他们将其称为BTIGSF。预测的 431 个氨基酸的 I 型跨膜蛋白与小鼠蛋白有 88% 的一致性,并与 IGSF 成员 CXADR 和 ESAM 具有同源性。IGSF11 具有 23 个残基的信号肽、3 个潜在的胞外 N 连接糖基化位点、一个胞外 V 型 Ig 样结构域、一个胞外 C2 型 Ig 样结构域和一个带有 C 端的 170 个残基的胞质尾PDZ 相互作用基序。每个 Ig 样结构域包含 2 个半胱氨酸。免疫印迹和糖苷酶分析显示 52 kD 糖蛋白的表达,该糖蛋白比预测的 44 kD 分子更大。Northern印迹分析显示IGSF11在睾丸中表达最高,在脑、肾和肾上腺中表达较低。在大脑中,胼胝体中的表达与睾丸中的表达相当。原位杂交分析检测到 IGSF11 在海马齿状回锥体层和胼胝体纤维中表达。
Katoh和Katoh(2003)基于微阵列分析结合激光捕获显微切割,利用生物信息学分析,将IGSF11鉴定为与据报道在肠型胃癌中频繁上调的EST相对应的基因(参见137215)。他们确定 IGSF11 基因编码 2 个由选择性剪接产生的亚型。较大的亚型由外显子 1a、2a、3a 和 4 至 9 组成,在睾丸和脑髓质中表达,而较小的亚型由外显子 1b 和 4 至 9 组成,在睾丸和大脑海马中表达。这两种异构体分别编码 430 和 431 个氨基酸的蛋白质,具有 97% 的氨基酸同一性。它们在 N 末端完全分歧,只有一种异构体具有信号肽。Katoh and Katoh(2003)提出IGSF11可以作为胃癌的诊断和/或药物递送靶点。
▼ 基因功能
Wang等人(2019)利用ELISA和人外周血单个核细胞(PBMC)裂解物的免疫共沉淀分析表明,人VSIG3与VISTA结合(VSIR;615608)。进一步分析表明,细胞表面表达的VSIG3作为VISTA的抑制性配体发挥作用,VSIG3-VISTA相互作用抑制人T细胞的活化并减少细胞因子和趋化因子的产生。
▼ 基因结构
Katoh and Katoh(2003)确定IGSF11基因含有10个外显子。
▼ 测绘
Suzu等人(2002)通过基因组序列分析,将IGSF11基因定位到染色体3q13-q21,该区域与某些胼胝体发育不全病例相关(见217990)。Katoh and Katoh(2003)通过基因组序列分析将IGSF11基因定位到染色体3q13.3。