SORTILIN; SORT1

神经降压素受体 3;NTSR3;NT3
神经降压素受体,100-KD

此条目中代表的其他实体:

SORT1 转录因子结合位点 1,包含在内

SORT1-TBS1,包括

HGNC 批准的基因符号:SORT1

细胞遗传学定位:1p13.3 基因组坐标(GRCh38):1:109,309,575-109,397,918(来自 NCBI)

▼ 说明

Sortilin 是一种包含 VPS10 的受体,可结合神经肽。它的名字来源于酵母液泡蛋白分选蛋白-10,该蛋白参与羧基肽酶Y从高尔基体到液泡的分选(Marcusson et al., 1994)。

▼ 克隆与表达

Petersen et al.(1997)利用膜蛋白提取物的RAP(104225)亲和层析分离了RAP结合蛋白分拣蛋白。通过cDNA文库筛选,他们克隆了相应的基因,该基因编码833个氨基酸的多肽,预计分子量为89 kD。该序列包括假定的分泌信号肽、弗林蛋白酶切割位点和单个跨膜结构域。它与酵母蛋白Vps10p和人类分拣蛋白相关受体(602005)同源。该蛋白的 C 末端含有 6-磷酸甘露糖受体共有的溶酶体分选基序。COS-1 细胞中分拣蛋白基因的表达导致内质网和高尔基体中出现 95-kD 的蛋白质。Petersen等人(1997)通过Northern blotting表明该基因在脑、脊髓、心脏、骨骼肌、甲状腺、胎盘和睾丸中以8-和3.5-kb转录本的形式高水平表达。

Mazella等人(1998)证明100-kD神经降压素受体(NT3)与分拣蛋白相同(Petersen等人,1997)。他们表示NT3不属于G蛋白偶联受体超家族。

含有葡萄糖转运蛋白Glut4(SLC2A4)的大鼠脂肪细胞囊泡;138190)还含有主要的110-kD蛋白质。Morris等人(1998)发现这个110kD的蛋白质就是分拣蛋白。大鼠和 3T3-L1 脂肪细胞的亚细胞分级分离以及 Glut4 囊泡分离表明,分拣蛋白主要位于含有 Glut4 的囊泡的低密度微粒体中。胰岛素(INS;通过细胞表面生物素化评估,(176730)导致 3T3-L1 脂肪细胞质膜上的分拣蛋白数量增加。3T3-L1 细胞中分拣蛋白的表达仅在分化时发生。

▼ 基因功能

Nykjaer等(2004)证明神经生长因子(NGF;NGF;162030),proNGF,通过同时结合 p75(NTR)(162010)和 sortilin 创建信号复合物。Sortilin 作为辅助受体和分子开关,控制 proNGF 诱导的 p75(NTR)介导的促凋亡信号。sortilin 与 p75(NTR)一起促进 proNGF 复合高亲和力结合位点的形成。因此,分拣蛋白作为辅助受体和分子开关,使表达TRK(191315)和p75(NTR)的神经元能够对前神经营养蛋白做出反应,并启动促凋亡而不是促存活的作用。在缺乏分拣蛋白的情况下,细胞外蛋白酶的受调节活性可能会将 proNGF 裂解为成熟的 NGF,从而促进 TRK 介导的生存信号。Nykjaer et al.(2004)得出结论,NGF诱导的神经元存活和死亡比以前想象的要复杂得多,因为它取决于proNGF和成熟NGF之间复杂的平衡,以及3种不同受体的空间和时间表达:TRKA、p75(NTR)、sortilin。

Shi和Kandror(2005)发现,在小鼠前脂肪细胞中,sortilin的表达增加了含有Glut4的储存囊泡的形成,并刺激胰岛素调节的葡萄糖摄取,而使用RNA干扰部分敲低sortilin则具有相反的效果。

Hu et al.(2010)在细胞研究中发现SORT1是PGRN(138945)的细胞表面结合位点。PGRN 通过其 C 末端与皮质神经元上的 SORT1 结合,该复合物经历内吞作用,并将 PGRN 递送至溶酶体。小鼠脊髓损伤后,运动神经元周围激活的小胶质细胞中诱导了 PGRN。Sort1缺失小鼠的大脑和血清中Pgrn水平增加了5倍,表明SORT1可以控制体内PGRN水平。Hu et al.(2010)提出了内体/自噬体/溶酶体途径在GRN相关FTLD发病机制中的作用(607485)。

▼ 基因结构

Hampe等(2001)通过计算机基因组学阐明了人类VPS10受体基因的外显子-内含子结构,包括分拣蛋白、分拣蛋白相关受体(602005)、SORCS1(606283)、SORCS2(606284)和SORCS3( 606285)。它们包含许多由内含子分隔的短外显子,其中一些延伸超过 50 kb。

SORT1 转录因子结合位点 1

Musunuru等人(2010)证明染色体1p13处常见的非编码多态性rs12740374创建了CEBP(116897)转录因子结合位点并改变了SORT1基因的肝脏表达。SNP rs12740374 位于 CELSR2(604265)和 PSRC1(613126)基因之间的 6.1 kb 非编码区。次要等位基因(T)创建结合位点,而主要等位基因(G)破坏它。电泳迁移率变动分析和染色质免疫沉淀证实 CEBP 与预测的共有位点结合。定量 RT-PCR 表明,CEBP 蛋白通过 rs12740374 影响 SORT1 表达,其中 rs12740374 处的次要等位基因导致 SORT1 表达增加。小鼠实验结果与人类队列的遗传发现一致,其中 1p13 小单​​倍型与肝脏 SORT1 表达增加和 LDL-C(尤其是非常小的 LDL 颗粒)降低相关。

▼ 测绘

Petersen et al.(1997)利用荧光原位杂交将SORT1基因定位到染色体1p21.3-p13.1。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 低密度脂蛋白胆固醇水平定量性状基因座 6

SORT1-TBS1,rs12740374

通过对人类队列、小鼠和肝细胞的一系列研究,Musunuru 等人(2010)提供了证据,证明染色体 1p13 处的单个非编码 DNA 变异 rs12740374 影响 LDL 胆固醇和心肌梗死(MI)风险(LDLCQ6;613589)通过CEBP转录因子对SORT1基因进行肝脏特异性转录调节。rs12740374 的次要等位基因(T)创建转录因子结合位点,而主要等位基因(G)则破坏它。CEBP 转录因子与该位点的结合导致 SORT1 表达增加并降低 LDL-C,尤其是非常小的 LDL 颗粒。该通路的临床重要性由替代 1p13 纯合子之间大约 40% 的 MI 风险差异决定,该效应与 LDLR(606945)和 PCSK9(607786)常见变异的效应相当,并且大于 HMGCR 常见变异的效应(142910),他汀类药物的靶点(Samani et al., 2007;心肌梗死遗传学联盟,2009)。由于 1p13 次要等位基因频率在欧洲人中约为 30%,并且在非裔美国人、西班牙裔、亚洲印度人和中国人等其他种族中也很常见,因此该位点是全球 MI 风险的重要决定因素。

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